教科書要改寫了?你開車在路上,紅綠燈同時亮起了紅燈和綠燈——這種完全違背常理的混亂,竟然就是科學家剛剛在一種微生物的遺傳密碼中發現的驚人真相,它直接粉碎了統治生物學界60年的“中心法則”鐵律!
這次顛覆性的發現,其意義可能遠超你的想象。它不僅挑戰了我們對生命底層邏輯的認知,更可能為治療包括囊性纖維化在內的10%遺傳性疾病打開全新的大門。這項重磅研究由加州大學伯克利分校(UC Berkeley)的Dipti Nayak教授和前研究生Katie Shalvarjian領銜,成果2025年11月6日剛剛發表在《美國國家科學院院刊》(PNAS)上。
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這一發現究竟有多離譜?讓我們走進這微觀世界的“法外之地”。
在生物學的世界里,有一套神圣不可侵犯的“密碼本”。DNA轉錄成RNA,RNA每三個堿基組成一個“密碼子”,對應一種氨基酸。絕大多數生物只用20種標準氨基酸來以此搭建生命的大廈。
在這個密碼本中,UAG(琥珀密碼子)的含義是絕對的:“停車!翻譯結束!”它是紅燈,是句號,是蛋白質合成的終點。
但是,科學家們早就注意到,有一類特立獨行的產甲烷古菌(Methanogenic archaea),它們擁有一種名為吡咯賴氨酸(Pyrrolysine,簡稱Pyl)的獨門秘籍——這是生物界的第22種氨基酸。這種氨基酸對它們代謝甲胺(一種存在于環境甚至人類腸道中的化合物)至關重要。
詭異的事情發生了:編碼這個Pyl氨基酸的密碼子,竟然就是那個代表“停止”的UAG
這就像在英語字典里,“STOP”這個詞同時也被定義為“GO”。細胞究竟是怎么搞清楚何時該停,何時該走的?
以前,科學家們認為這背后一定有精密機關。比如第21種氨基酸(硒半胱氨酸),就需要一個特殊的“通行證”(SECIS序列)才能讓核糖體無視紅燈,強行通過。
于是,伯克利的研究團隊對模式生物——巴氏甲烷八疊球菌(Methanosarcina acetivorans展開了地毯式搜索,試圖找到類似的“通行證”。
結果令人大跌眼鏡:根本沒有!
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為了實錘,研究人員對這種古菌中的關鍵基因rdmS進行了測試。如果UAG代表停止,你會得到一個短蛋白(26.2 kDa);如果UAG代表Pyl,你會得到一個長蛋白(112.8 kDa)。
Western Blot實驗結果出來的那一刻,所有人都沉默了:兩條條帶同時出現了。
這意味著,同一個mRNA上的同一個UAG位點,在同一個細胞里,既被讀成了“停止”,也被讀成了“繼續”。這根本不是什么精密調控,而是一場“模棱兩可”的賭博!
細胞似乎在說:“我也不知道該咋辦,干脆兩個都要吧。”
這種混亂難道不會導致細胞崩潰嗎?造出一堆錯誤的蛋白質垃圾,細胞不就死翹翹了?
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但事情顯然不是這樣,研究團隊提出了一個基于“供需關系”的模型。
當這種古菌生活在甲胺環境中時,它需要大量合成甲基轉移酶(這些酶里全是UAG密碼子),對Pyl的需求激增(Demand),遠遠超過了供應(Supply)。這就導致UAG的“通讀效率”實際上降低了,大部分時候還是當作“停止”來用。
這聽起來像是個Bug(缺陷),但實際上是個Feature(特性)。為了在混亂中求生,這種古菌在漫長的進化中做了一次壯士斷腕般的“基因大清洗”:
它們把基因組里絕大多數無關緊要的UAG都刪掉了!在普通生物中,UAG作為終止信號的使用率可能高達22%,但在這類古菌中,這一比例被壓縮到了驚人的5%甚至更低(1%-5%)。
換句話說,既然我分不清紅綠燈,那我就把路上絕大多數紅綠燈都拆了,只保留必須的那幾個!
這項研究告訴我們要對大自然保持敬畏。生命并不總是精確的機器,有時候,適度的“模糊”和“混亂”反而是生存的最高智慧。
如果這種機制能被人類掌握,也許在未來,我們就能通過人為制造一點“混亂”,讓那些因為基因突變導致蛋白提前終止的遺傳病患者,重新獲得生命的希望。
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參考文獻:
- Shalvarjian, K. E., et al. (2025). Methanogenic archaea encoding Pyrrolysine maintain ambiguous amber codon usage.Proceedings of the National Academy of Sciences, 122(45), e2517473122.
- University of California - Berkeley. (2025, December 4). Scientists Have Discovered an Organism That Breaks Biology’s Golden Rule.
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