四川
第52卷 第1期
作者：同海欣;湯旭升;梁鵬;尚林東;趙志偉;李備;
作者單位：1.中國科學院長春光學精密機械與物理研究所 2.中國科學院大學 3.應用光學國家重點實驗室 4.中國科學院光學系統(tǒng)先進制造技術重點實驗室 5.長春長光辰英生物科學儀器有限公司
摘要：
為解決微生物菌落培養(yǎng)研究中菌落挑取、培養(yǎng)、鑒定工作量大、重復度高的問題，提出一種基于光學成像的菌落去重復挑選策略。通過宏觀成像對菌落進行計數(shù)和定位，與通過微觀成像獲取的菌落特征信息結合，并使用貪心算法對獲得特征信息的菌落進行挑選，實現(xiàn)菌落挑選的去重復工作。該方法成功建立了多維度菌落識別方法與技術路線，將200個菌落樣本的挑選方案的獲得縮減至5 min內(nèi)，且當挑菌數(shù)與菌落樣本種數(shù)之比為3時，菌落覆蓋率超過90%。與傳統(tǒng)的人工去重復和連續(xù)稀釋法進行菌株挑選相比，基于光學成像的菌落挑選策略能夠提高菌落挑選效率，降低人力資源成本，并有效提高挑菌的覆蓋率。
關鍵詞：
菌落; 去重復挑選; 光學成像; 挑選覆蓋率;
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