在美國斯坦福大學(xué)生物工程系亓磊副教授的實(shí)驗(yàn)室里,博士生陳心怡盯著顯微鏡的屏幕,感到十分困惑。
她原本想讓嵌合抗原受體T(CAR-T)細(xì)胞識別并殺死癌細(xì)胞,可詭異的是,一些CAR-T細(xì)胞的表面竟然出現(xiàn)了不屬于它們的分子,這些分子似乎是從癌細(xì)胞身上“偷”來的。
陳心怡的導(dǎo)師亓磊多年來一直關(guān)注著免疫細(xì)胞之間的相互作用。了解到這件事后,亓磊告訴陳心怡,這或許正是“胞啃”(trogocytosis)現(xiàn)象。
去抓犯人的臥底警察,同伴卻以為你已經(jīng)叛變
所謂“胞啃”,描述的是一種奇特的細(xì)胞行為:當(dāng)兩個細(xì)胞緊密接觸時,它們會從對方細(xì)胞表面“啃”下一小塊細(xì)胞膜,連同膜上的分子一起轉(zhuǎn)移到自己身上。這是一個古老的機(jī)制,早在20世紀(jì)70年代,免疫學(xué)家就注意到了這種奇特的現(xiàn)象。但直到21世紀(jì)初,它才有了“胞啃”這個形象而略顯粗暴的名字。
這個看似簡單的過程,既是陳心怡所面臨的難題,多年來也一直困擾著免疫學(xué)家:當(dāng)CAR-T細(xì)胞緊貼癌細(xì)胞并發(fā)生胞啃后,它們可能會把癌細(xì)胞表面的一些標(biāo)志性分子帶到自己身上。于是,這些原本負(fù)責(zé)追殺癌細(xì)胞的免疫細(xì)胞,外表就會開始變得像癌細(xì)胞。
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CAR-T細(xì)胞原本應(yīng)精確識別并殺死癌細(xì)胞丨圖蟲創(chuàng)意
這會帶來雙重麻煩。一方面,這些被“污染”的CAR-T細(xì)胞自身功能有可能受損。同時,其他CAR-T細(xì)胞又可能將變了樣的同伴錯當(dāng)成癌細(xì)胞,轉(zhuǎn)而攻擊隊(duì)友。
亓磊打了個比方,用電影《無間道》來形容這種困境:你本來是去抓犯人的臥底警察,結(jié)果同伴卻以為你已經(jīng)叛變,反過來要置你于死地。
翻閱著一篇又一篇關(guān)于“胞啃”的論文,陳心怡心里有些沮喪,原來這并不是什么新鮮發(fā)現(xiàn)。幾十年來,科學(xué)家一直在試圖阻止胞啃的發(fā)生,把它當(dāng)作必須消除的副作用。但亓磊和陳心怡意識到,胞啃不只是副作用,而是一個大自然已經(jīng)優(yōu)化了幾億年的“接口”。
兩個細(xì)胞只要“握一下手”,就能將自己表面的分子帶到對方身上。這難道不是一種天然的遞送機(jī)制嗎?只不過與傳統(tǒng)的遞送方式不同,這里負(fù)責(zé)運(yùn)貨的是一個活生生的細(xì)胞。這種特殊之處或許正是解決藥物遞送難題的關(guān)鍵,尤其是CRISPR等基因編輯工具的遞送。
基因編輯的三大挑戰(zhàn):遞送、遞送、遞送
對亓磊而言,這正是他夢寐以求的目標(biāo)。從博士階段開始,他就在研究和開發(fā)基于CRISPR的基因編輯工具。2012年,他曾與其博士生導(dǎo)師、身為諾獎得主的CRISPR技術(shù)先驅(qū)珍妮弗·杜德納(Jennifer Doudna)合作,是最早一批探索利用CRISPR進(jìn)行基因編輯的研究者之一。
再強(qiáng)大的基因編輯工具,也都得先送進(jìn)細(xì)胞才能發(fā)揮作用,但在活體內(nèi)直接使用CRISPR進(jìn)行基因編輯始終困難重重。CRISPR技術(shù)誕生至今已有十幾年,但真正能在臨床體內(nèi)應(yīng)用的目前也只有一兩個。許多正在臨床測試中的療法,效果也不及預(yù)期。
問題并不出在CRISPR技術(shù)本身,而是卡在了遞送上。
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CRISPR技術(shù)誕生至今已有十幾年,但真正能在臨床體內(nèi)應(yīng)用的目前也只有一兩個丨圖蟲創(chuàng)意
目前能用來遞送基因編輯工具的辦法并不多,主流選擇無非是病毒載體和脂質(zhì)體等。但病毒遞送伴隨著安全性和免疫原性方面的擔(dān)憂,脂質(zhì)體遞送又容易富集到肝臟,因此針對肝臟以外的疾病往往效果不佳。
遞送難題早已成為基因編輯領(lǐng)域的共識,甚至是整個生物醫(yī)學(xué)界都默認(rèn)的一道難關(guān)。諾獎得主、研究生物正交化學(xué)的卡羅琳·貝爾托齊(Carolyn Bertozzi)和亓磊的實(shí)驗(yàn)室在斯坦福大學(xué)的同一棟樓,她曾半開玩笑地對亓磊說:“你們基因編輯領(lǐng)域最大的三個挑戰(zhàn),就是遞送、遞送、遞送。”
而胞啃或許就是這個突破口。亓磊認(rèn)為,在基因編輯領(lǐng)域,人們過去更多是在現(xiàn)有遞送方式上修修補(bǔ)補(bǔ),試圖解決其中的問題并提升效果,但這些方法從一開始就帶有某些根本性的限制。他們需要走一條全新的路徑,看看能否解決現(xiàn)有方法無法解決的問題。
生物學(xué)家里,十有八九都沒聽說過它
可真要把胞啃變成一種遞送工具,遠(yuǎn)沒有聽上去那么簡單。
胞啃被發(fā)現(xiàn)至今已經(jīng)過去了幾十年,但科學(xué)家對它的了解依然相當(dāng)有限。這個詞在生物學(xué)之外幾乎鮮為人知,就連在專業(yè)圈子里,它也算不上一個廣為人知的概念。亓磊估計(jì),即便是有生物學(xué)背景的人,十個里恐怕也有八個沒聽說過胞啃。
更麻煩的是,科學(xué)家對于胞啃的了解,還停留在現(xiàn)象描述上。人們只知道某些細(xì)胞類型之間能發(fā)生胞啃,卻并不清楚它是如何開始的,以及背后有哪些分子機(jī)制。至于那些被“啃”下來的細(xì)胞膜和膜上的分子,在進(jìn)入另一個細(xì)胞之后會經(jīng)歷什么,也都沒有清晰的答案。
陳心怡手里并沒有可供參考的“地圖”,卻要在這樣的基礎(chǔ)上開發(fā)一種全新的遞送工具,這無疑是一場冒險。不過在亓磊看來,科學(xué)研究正需要這種更前瞻、更具探索性的嘗試。他回憶起2012年開始研究CRISPR技術(shù)時的情景,那時他連Cas9長什么樣都不知道,可還是硬生生將它改造成了能在細(xì)胞里調(diào)控轉(zhuǎn)錄的CRISPRi工具。
正是抱著這樣的探索心態(tài),他們決定一邊研究胞啃的機(jī)制,一邊試著將它改造成一種用于遞送的工具。
研究很快有了一些發(fā)現(xiàn)。胞啃現(xiàn)象發(fā)生需要滿足一定條件,它取決于胞啃細(xì)胞表面是否存在特定的分子“指紋”,能否相互識別并進(jìn)而“握手”。只有當(dāng)兩個細(xì)胞建立起足夠“親密”的連結(jié),胞啃才會發(fā)生。同時胞啃現(xiàn)象發(fā)生得非常快,兩個細(xì)胞接觸之后,往往幾分鐘內(nèi)就會開始相互“啃食”。
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粉色細(xì)胞正在通過胞啃將紅色熒光蛋白mCherry遞送給綠色細(xì)胞丨受訪者供圖
而且,能夠發(fā)生胞啃的細(xì)胞可能遠(yuǎn)比人們以為的多得多。他們在實(shí)驗(yàn)室里測試了近10種細(xì)胞,結(jié)果都能發(fā)生胞啃。結(jié)合人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas)數(shù)據(jù)庫進(jìn)一步推算,他們發(fā)現(xiàn)人體內(nèi)很可能有近100種細(xì)胞都能通過特定方式被精準(zhǔn)引導(dǎo)發(fā)生胞啃。
一個思路逐漸清晰起來:既然CAR-T細(xì)胞療法的核心是改造T細(xì)胞,讓它特異而緊密地結(jié)合癌細(xì)胞,那么同樣的方法也許可以被化用到這里。只要讓改造后的細(xì)胞能主動、精準(zhǔn)地貼近目標(biāo)細(xì)胞,那么它或許就能借助胞啃,把自己攜帶的成分遞送出去。
向自然學(xué)習(xí),或可絕處逢生
但事情再次偏離了設(shè)想。
當(dāng)陳心怡開始嘗試用工程化改造過的細(xì)胞來遞送時,她發(fā)現(xiàn)盡管這些細(xì)胞能將細(xì)胞膜上的分子遞送給目標(biāo)細(xì)胞,但絕大部分遞送過去的分子都沒有功能。它們進(jìn)入了目標(biāo)細(xì)胞的溶酶體,被那里的酸性環(huán)境降解了。她嘗試了不少辦法,結(jié)果都是如此。
陳心怡不得不重新審視前人的觀察。過去一些研究曾報道某些分子會通過胞啃出現(xiàn)在其他細(xì)胞表面,但現(xiàn)在看來,這些分子未必真的具有功能。它們有可能只是粘在那兒,很不穩(wěn)定,洗幾次就掉了。
這個發(fā)現(xiàn)一度讓她非常沮喪。前人的研究經(jīng)驗(yàn)可能并未展現(xiàn)故事的全貌,她不能把那些結(jié)論視為理所當(dāng)然。
不過,既然能從“糟糕”的胞啃現(xiàn)象中找到新用途,那么能否也從溶酶體出發(fā)尋找突破口,讓那些分子在降解之前逃離溶酶體呢?順著這個思路,他們開始嘗試前人用過的一些策略,仍然一次又一次地失敗了。
接連碰壁之后,他們選擇將目光重新投回自然界本身。多年來,亓磊實(shí)驗(yàn)室一直秉承著一個原則:很多看似棘手的技術(shù)難題,也許早已在自然演化中出現(xiàn)了某種解法。從大自然中尋找靈感,把自然界中的東西變成人類能夠利用的東西,也是研究生物工程的樂趣所在。
于是他們提出了一個思路:向病毒學(xué)習(xí)。自然界中的某些病毒在感染細(xì)胞后,必須先進(jìn)入較早期的溶酶體,再設(shè)法逃逸出來,才能繼續(xù)生命歷程。如果病毒能在這樣的環(huán)境中成功脫身,那么病毒身上的某些元件也許能幫助那些通過胞啃進(jìn)入細(xì)胞的分子逃離溶酶體。
最終,他們找到了水皰性口炎病毒上的一種蛋白質(zhì)——VSVG。陳心怡試著把VSVG整合到了用于胞啃遞送的工程細(xì)胞表面。這次的結(jié)果終于不一樣了:目標(biāo)細(xì)胞表面明顯出現(xiàn)了由工程細(xì)胞遞送而來的、有功能的蛋白質(zhì)。更讓人興奮的是,這一現(xiàn)象在他們測試的幾乎所有目標(biāo)細(xì)胞類型中都能看到。
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胞啃遞送示意圖丨ChatGPT
沿著酸性環(huán)境這條線索,他們又找到了一段會在酸性條件下自動切割的氨基酸序列,并把它接到了想遞送的目標(biāo)蛋白質(zhì)上。這樣一來,當(dāng)這些蛋白質(zhì)隨著胞啃進(jìn)入目標(biāo)細(xì)胞內(nèi)部、到達(dá)早期溶酶體后,就會在酸性環(huán)境中從膜上脫落,再借助VSVG逃離至目標(biāo)細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)乃至細(xì)胞核。陳心怡把這個過程形容為“坐纜車”:遞送的蛋白質(zhì)先借由胞啃進(jìn)入目標(biāo)細(xì)胞,然后在溶酶體里下車,最終去往自己真正該去的地方。
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胞啃遞送機(jī)制丨受訪者供圖
由此,通過胞啃遞送的蛋白質(zhì)類型和用途也大大拓寬了。借助這些“胞啃使者”,他們不僅遞送了基因編輯工具,也遞送了能用于殺傷癌細(xì)胞的成分,甚至還遞送了堿基編輯器這類體積更大、通常難以用病毒等方法運(yùn)送的分子機(jī)器。
最終,他們將這些結(jié)果整理成論文,并于今年4月發(fā)表在了《自然·細(xì)胞生物學(xué)》[1](Nature Cell Biology)上。
去思考一些邊緣、甚至奇怪的問題
不過在亓磊看來,這些成果只是一個開始。
成功讓活細(xì)胞利用胞啃來遞送大分子固然是關(guān)鍵的一步,但亓磊還有更大的野心,他希望將這些“胞啃使者”開發(fā)成可編程的活體遞送系統(tǒng):當(dāng)這些細(xì)胞進(jìn)入體內(nèi)后,它們將能自主識別多種疾病信號,主動抵達(dá)該去的器官和靶細(xì)胞。
亓磊認(rèn)為,這種設(shè)想背后也許是一種新的醫(yī)學(xué)圖景:“傳統(tǒng)藥物都是基于化學(xué)的,但未來的醫(yī)學(xué)將很大程度上基于生物學(xué)。基于活細(xì)胞來制藥是我們的愿景。這種方法能實(shí)現(xiàn)傳統(tǒng)化學(xué)藥物無法實(shí)現(xiàn)的精準(zhǔn)性和可編程性。”從發(fā)明CRISPRi來調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄,到利用胞啃來解決遞送問題,他的研究始終是構(gòu)建一套完整的生命編程系統(tǒng)。
為了走向這個目標(biāo),他們還要回答許多更具體的問題。比如,不同類型細(xì)胞之間的胞啃究竟有哪些差異,哪種細(xì)胞更適合在體內(nèi)充當(dāng)“胞啃使者”,以及一旦這種方法真的在人體內(nèi)應(yīng)用會造成哪些影響。
在免疫治療中,胞啃常常以副作用的面貌出現(xiàn)。可在正常生理?xiàng)l件下,胞啃究竟扮演著什么角色,人們并不完全清楚。它或許是細(xì)胞之間交換信息的一種方式,或許能增強(qiáng)某些細(xì)胞的功能,也可能參與免疫系統(tǒng)的調(diào)節(jié)。但這些猜想大多還在等待更加扎實(shí)的證據(jù)。
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亓磊(左)和陳心怡(右)丨受訪者供圖
對陳心怡而言,這條路走到現(xiàn)在,最深的感受是科研的不確定性。她說:“科研沒有一條最好的路徑,也很難有什么時間點(diǎn)來判斷自己做的東西究竟還能走多遠(yuǎn)。我們總是在遇見預(yù)期之外的事情,有時是驚喜,有時是失敗,但這也正是科研最美妙的點(diǎn)。”
而在亓磊看來,他們的工作提醒著人們,奇怪的現(xiàn)象背后通常隱藏著更重要的生物學(xué)意義,它們值得深入研究。他說:“我們不是在修補(bǔ)一個現(xiàn)有的工具,而是在定義一種全新的遞送范式。通過胞啃,我們讓細(xì)胞具備了像生物計(jì)算機(jī)一樣精準(zhǔn)傳輸信息的能力。這正是編程生命的核心。”
參考文獻(xiàn)
[1] https://www.nature.com/articles/s41556-026-01920-0
作者:黃雨佳
編輯:黎小球
封面圖來源:Nano Banana 2
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