PAIso-seq2技術(shù)揭示poly(A)尾調(diào)控新世界

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RNA的尾巴，遠(yuǎn)比我們想象得復(fù)雜

mRNA 3′端的poly(A)尾長期被認(rèn)為只是由一串腺苷組成的簡單結(jié)構(gòu)AAAAAAAAAAAAA，它的主要功能被認(rèn)為參與mRNA穩(wěn)定性、翻譯起始及RNA出核調(diào)控。

然而，隨著高分辨率測序技術(shù)的發(fā)展，研究人員逐漸意識到poly(A)尾并不是簡單的“A尾巴”，而是一個高度動態(tài)、攜帶調(diào)控信息的RNA結(jié)構(gòu)。但由于poly(A)尾屬于長同聚體序列（homopolymer），傳統(tǒng)二代測序技術(shù)難以對其準(zhǔn)確解析，長期以來限制了相關(guān)研究的發(fā)展。

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PAIso-seq2：精準(zhǔn)解析poly(A)尾結(jié)構(gòu)

新使生物（NeoRibo）依托中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所陸發(fā)隆研究團(tuán)隊，完成PAIso-seq2技術(shù)轉(zhuǎn)化，正式推出包含完整poly(A)尾的全長轉(zhuǎn)錄組測序解決方案。

該技術(shù)基于PacBio HiFi長讀長測序，實現(xiàn)單分子水平解析：

poly(A)尾精確長度

poly(A)尾內(nèi)部堿基組成（A/U/C/G）

全長轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)（isoform），包含可變剪切以及加尾位點信息

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Poly(A)尾檢測技術(shù)比較

技術(shù)

poly(A)長度

堿基類型

全長轉(zhuǎn)錄本

樣本需求

TAIL-seq

低精度

?(僅末端)

大量

ONT DRS

中精度

?低精度

超大量

FLAM-seq

高精度

?(僅內(nèi)部)

大量

PAIso-seq2

高精度

?高分辨率

微量

PAIso-seq2是可高精度同時解析poly(A)尾長度、堿基組成、全長轉(zhuǎn)錄本及其異構(gòu)體信息的技術(shù)方案！

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連接RNA命運(yùn)與翻譯調(diào)控的關(guān)鍵樞紐

隨著研究深入，poly(A)尾已被認(rèn)為是決定RNA命運(yùn)的重要調(diào)控層面，并直接參與翻譯調(diào)控過程。

1）調(diào)控RNA穩(wěn)定性與降解
poly(A)尾長度變化是RNA降解的重要信號。隨著去腺苷化發(fā)生，mRNA穩(wěn)定性下降并進(jìn)入降解通路。同時，poly(A)尾末端的U和G等非A堿基進(jìn)一步影響RNA穩(wěn)定性。

2）
poly(A)尾通過結(jié)合PABP促進(jìn)翻譯起始復(fù)合物形成，從而起始蛋白質(zhì)翻譯，是連接mRNA與蛋白表達(dá)的重要橋梁。

3）參與RNA重塑過程
在卵母細(xì)胞及早期胚胎發(fā)育中，mRNA會經(jīng)歷poly(A) 尾的動態(tài)重塑（脫腺苷化與再加尾），說明RNA命運(yùn)可以被重新編程，該過程可能也在生殖之外的生物學(xué)過程中廣泛存在。

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PAIso-seq2技術(shù)應(yīng)用場景

PAIso-seq2適用于多種RNA調(diào)控相關(guān)研究場景，尤其適合以下方向：

1）發(fā)育與生殖研究
在卵母細(xì)胞、早期胚胎等微量樣本中，poly(A)尾動態(tài)變化與母源mRNA調(diào)控密切相關(guān)。PAIso-seq2可在低起始量條件下，解析poly(A)尾結(jié)構(gòu)重塑過程。

2）腫瘤與疾病研究
在腫瘤或疾病狀態(tài)下，RNA穩(wěn)定性與翻譯調(diào)控常發(fā)生改變。通過poly(A)尾特征分析，可挖掘異常RNA調(diào)控機(jī)制及潛在分子標(biāo)志物。

3）植物與多物種研究
適用于植物及多種模式生物，研究不同物種中poly(A)尾調(diào)控差異及環(huán)境響應(yīng)機(jī)制。

4）RNA降解與質(zhì)量控制研究
解析脫腺苷化（deadenylation）、尿苷化（uridylation）等過程，系統(tǒng)研究RNA降解路徑及質(zhì)量控制機(jī)制。

5）翻譯調(diào)控研究
結(jié)合Ribo-seq和Polysome profiling，從poly(A)尾到核糖體占據(jù)，實現(xiàn)從RNA到蛋白表達(dá)的完整調(diào)控解析。

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新使生物PAIso-seq2技術(shù)優(yōu)勢

• 高分辨率poly(A)解析能力（長度及堿基）

• 全長轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體解析

• 適用于多物種（動物、植物及臨床樣本）

• 支持細(xì)胞和組織樣本

• 可針對微量起始樣本（卵母細(xì)胞）

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全方位翻譯組學(xué)與RNA調(diào)控解決方案

新使生物專業(yè)翻譯組學(xué)平臺，構(gòu)建了覆蓋RNA調(diào)控的翻譯多組學(xué)技術(shù)體系：

1. 高分辨率Ribo-seq：解析核糖體占據(jù)與翻譯動態(tài)

2. Polysome profiling：評估翻譯活性與mRNA分布狀態(tài)

3. RNC-seq：捕獲核糖體結(jié)合RNA，反映翻譯進(jìn)行中的轉(zhuǎn)錄本

4. tRNA-seq：解析翻譯系統(tǒng)的解碼能力

5. PAIso-seq：解析poly(A)尾長度與組成，連接mRNA穩(wěn)定性與翻譯效率

6. GLORI-seq：m?A絕對定量檢測，探究RNA修飾對翻譯調(diào)控的影響

通過多組學(xué)整合，可以系統(tǒng)解析poly(A)尾→mRNA穩(wěn)定性→翻譯效率→蛋白表達(dá)的過程，從而更加深入理解RNA調(diào)控與翻譯機(jī)制。

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產(chǎn)品名稱

PAIso-seq2（Poly(A)尾測序）

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新使生物NeoRibo推出國內(nèi)首個。

開創(chuàng)性的建庫技術(shù)使得Ribo-seq核糖體印跡分析（QEZ-seq?）具有超高的分辨率，且適用于哺乳動物、植物、真菌等多類物種。

我們能夠針對微量細(xì)胞或組織，如卵母細(xì)胞、卵巢、臨床穿刺樣品等產(chǎn)出高質(zhì)量翻譯組數(shù)據(jù)結(jié)果。

超高的準(zhǔn)確性為研究非經(jīng)典的開放閱讀框（ORFs）提供極大便利，提高微肽(腫瘤新生抗原）的挖掘效率。

另外新使生物提供多物種,了解更多翻譯組技術(shù)信息可登錄 www.neoribo.com。