上海
題圖 | Pixabay
撰文 | 宋文法
梅毒螺旋體是一種細小的呈螺旋狀的細菌，會引起如梅毒、雅司病等傳染性疾病，但由于遠古基因組數據匱乏，其起源和演化歷史一直存在爭議。
2026年1月22日，美國加州大學、瑞士洛桑大學研究團隊在"Science"期刊上發表了一篇題為" A 5500-year-old Treponema pallidum genome from Sabana de Bogotá，Colombia "的研究論文。
這項研究破解了梅毒起源之謎，研究團隊成功從哥倫比亞5500年前古人遺骸中提取了梅毒螺旋體基因組，將梅毒基因組記錄向前推進了3000多年，為破解梅毒起源、傳播與演化提供了前所未有的分子證據。
圖：論文截圖
在這項研究中，研究人員分析了來自一名45-60歲以上的成年男性遺骸，其死亡時間在公元前5464年至公元前5309年之間，通過對古人類骨骼樣本進行高通量測序與宏基因組篩查，意外發現了梅毒螺旋體的DNA痕跡，并成功重建出完整古梅毒螺旋體基因組。
過宏基因組篩查技術，研究團隊意外發現了梅毒螺旋體的DNA痕跡，并成功重建出覆蓋度達1.7倍、完整度78.5%的梅毒螺旋體基因組，命名為TE1-3。然而，這具遺骸并無梅毒螺旋體感染典型的骨骼病變特征。
進一步分析顯示，TE1-3屬于梅毒螺旋體物種，與現代梅毒、雅司病等相關病原體亞種的基因組對比，TE1-3是所有已知現代梅毒螺旋體亞種的早期分化姐妹譜系，是一種此前未知的古老譜系。
分子鐘分析顯示，E1-3與現代梅毒亞種的共同祖先約在1.37萬年前分化，恰逢人類進入美洲后不久，表明梅毒螺旋體在哥倫布抵達美洲之前數千年已在當地人群中傳播，在美洲人類定居后不久，梅毒螺旋體已開始多樣化，挑戰了傳統的“哥倫布輸入”單一假說。
此外，基因組分析顯示，盡管相隔5500年，TE1-3仍攜帶現代梅毒螺旋體菌株中常見的毒力相關基因，表明這一古老病原體已具備感染人類的潛力。
圖：論文截圖
研究人員表示，這一結論表明，在美洲人類定居后不久，梅毒螺旋體已開始多樣化，挑戰了該病原體僅起源于亞非大陸的傳統觀點。這是首次在完全沒有骨骼病變特征個體中，通過DNA測序技術發現梅毒病原體，表明古代感染可能遠比我們通過骨骼記錄所見的更為普遍。
綜上，TE1-3的發現，將梅毒基因組記錄向前推進了3000多年，也提示我們，許多現代傳染病的故事早在史前就已寫下。
參考文獻：
https://doi.org/10.1126/science.adw3020
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