珊瑚礁是海洋中生命律動最劇烈的場域:盡管其面積僅占海底總面積的不到百分之一,卻養育了地球上超過三分之一的海洋動植物物種。這種驚人的生物多樣性正籠罩在海水升溫的陰影之下。
在那些肉眼可見的珊瑚礁居民之外,無數微觀層面的生命形式同樣深陷生存危機。這些微生物通常與珊瑚、海綿以及其他礁石棲息者維持著微妙的共生關系。為了在殘酷的生存競爭中抵御病原體、捕食者和競爭對手,微生物進化出了一套龐大的天然產物武器庫,而這對于人類醫療與生物技術而言,無異于一座極具價值的寶礦。
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發表在《自然》雜志上的一項最新研究,向世人展示了這座“天然藥庫”一旦流失可能造成的巨大損失。這項由蘇黎世聯邦理工學院辛一·砂川和約恩·皮爾領導的研究團隊,聯合洛桑聯邦理工學院的盧卡斯·保利及塔拉太平洋聯盟共同完成。該研究在珊瑚體內鑒定出了具有合成新型物質潛力的微生物新物種。
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研究人員細致分析了800多份珊瑚樣本,這些樣本源自十年前“塔拉”號科考船橫跨太平洋的遠征采集。這些珍貴的素材大多取自能夠構建礁石的千孔珊瑚或石珊瑚。
團隊首先對樣本中的微生物脫氧核糖核酸片段進行了深度測序。隨后,通過蘇黎世聯邦理工學院的高性能計算機集群,他們成功重建了645種細菌和古菌的基因組。辛一·砂川指出,在這些物種中,超過99%的基因組信息此前在科學界完全是一片空白。
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通過與公海海水樣本的橫向對比,研究發現這些微生物并非散布于廣闊的太平洋中,而是呈現出極強的地域依賴性——它們僅存在于珊瑚礁內部。更進一步的是,這些微生物傾向于寄宿在特定類型的珊瑚身上,不同屬的珊瑚之間幾乎不存在微生物的重疊。
辛一·砂川觀察到,這些微生物通常棲息在宿主珊瑚的表面和消化道內,并形成了一個極為復雜的微觀生態系統。這種共生模式與人類的皮膚及腸道微生物組具有高度的相似性。
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研究者的野心并未止步于對新物種的分類描述,他們更試圖揭開這些微生物可能合成的生化物質面紗。通過對天然產物背后遺傳“藍圖”的深度審視,他們發現了一座隱藏的寶庫。
“我們在珊瑚礁微生物基因組中發現的天然產物合成潛力,比此前在整個公海范圍內的發現還要巨大,”辛一·砂川如是說。這種潛力的形成或可歸因于珊瑚礁極高的生命密度:在如此擁擠的生存環境中,擁有多樣化化學防御手段的生物顯然更具競爭優勢。
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在辛一·砂川看來,現有的發現僅僅是揭開了帷幕的一角。在最新的研究中,團隊僅考察了3個屬的珊瑚,而全球已知的珊瑚屬有數百個,包含數千個物種。除此之外,海綿、軟體動物和藻類等其他物種繁茂的海洋生物,其背后的微生物組研究仍處于起步階段。
研究人員對這種巨大的知識鴻溝及其潛在后果深感憂慮。如果珊瑚礁的生物多樣性持續萎縮,將意味著數千種大多未知的微生物物種將面臨不可逆轉的消亡。
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約恩·皮爾認為,針對珊瑚礁的分子層級研究為未來的生物技術和醫學應用提供了無限可能。辛一·砂川則發出緊迫呼吁,強調人類正處于挖掘并保護這一潛在價值的時間競賽中。因此,將微生物組納入珊瑚礁保護的宏觀框架中,已成為當前生態保護工作的當務之急。
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