廣東
近日，河南省農科院蔬菜研究所與河北農業大學園藝學院等國內外10多家單位合作在《Science》期刊上發表題為“Gapless pangenome analyses reveal fast Brassica rapa subspeciation”的研究成果。河北農業大學為第一完成單位，河南省農科院蔬菜研究所為第二完成單位。河北農業大學馬衛教授為論文第一作者，河南省農科院魏小春研究員為共同第一作者。河北農業大學趙建軍教授、馬衛教授和洪益國教授，河南省農科院原玉香研究員，比利時根特大學Yves Van de Peer教授為共同通訊作者。
研究團隊通過對1720份白菜種質進行重測序，精選7個亞種11份“諸侯”代表性材料進行端粒到端粒（T2T）完整基因組組裝，并識別出110個著絲粒，同時挖掘到5個與物種形成和分化密切相關的著絲粒特異衛星重復序列。在此基礎上，結合31份白菜基因組構建泛基因組，系統解析了著絲粒重塑與大規模結構變異對白菜亞種快速分化的共同作用；并通過泛基因組關聯分析與突變體功能驗證，鎖定控制葉球形成的關鍵基因BrLH1，將具體亞種的形成與泛遺傳變異直接關聯起來，為理解被子植物實現快速多樣化提供了基因組學支撐。
該研究從基因組、泛基因組和泛遺傳學三個層面系統刻畫了白菜亞種快速分化的遺傳基礎，把被子植物“快速擴張”的經典問題研究具體落實到一個肉眼可見的演化框架之中；通過構建完整著絲粒圖譜，揭示了衛星重復、著絲粒動態與結構變異在蕓薹屬物種演化中的關鍵作用，加深了對蕓薹屬基因組起源與分化順序的認識；同時，這一系列高質量圖譜與分析體系，也為今后在蕓薹屬乃至更廣泛十字花科作物中開展功能和演化研究提供了研究范例。
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