全球數(shù)據(jù)量正以驚人速度爆炸式增長(zhǎng),無論是傳統(tǒng)硬盤、磁帶,還是云存儲(chǔ)中心,都面臨著能耗高企、容量瓶頸和安全隱患等問題。為突破存儲(chǔ)瓶頸,科學(xué)家們將目光投向大自然中最精密的信息載體:DNA。
作為地球上最緊湊、最持久的信息載體,DNA 在理論上能將全球所有數(shù)據(jù)裝進(jìn)一個(gè)鞋盒大小的空間里,穩(wěn)定保存數(shù)千年,且復(fù)制成本極低。但長(zhǎng)期以來,DNA 存儲(chǔ)存在一個(gè)致命短板:數(shù)據(jù)一旦被“寫入(合成)”,就變成了永久性的“只讀”文件,無法修改或擦除。
直到近日,美國(guó)密蘇里大學(xué)(University of Missouri)的研究團(tuán)隊(duì)在《美國(guó)科學(xué)院院刊-連結(jié)》(PNAS Nexus)上發(fā)表了一項(xiàng)突破性研究,有望徹底改變這一局面。他們成功擺脫了昂貴的 DNA 從頭合成與酶促反應(yīng)的限制,開發(fā)出全球首個(gè)無合成、無酶、可反復(fù)重寫的 DNA 記憶系統(tǒng),讓 DNA 從“一次性膠片”升級(jí)為可反復(fù)擦寫的“分子硬盤”。
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(來源:PNAS Nexus)
DNA 存儲(chǔ)的優(yōu)勢(shì)與“只讀”痛點(diǎn)
在傳統(tǒng)的硅基計(jì)算機(jī)中,信息以“0”和“1”的二進(jìn)制形式存儲(chǔ),DNA 數(shù)據(jù)存儲(chǔ)則更進(jìn)一步,將這些二進(jìn)制位轉(zhuǎn)換為構(gòu)成 DNA 的四種化學(xué)堿基字母:A(腺嘌呤)、C(胞嘧啶)、G(鳥嘌呤)和 T(胸腺嘧啶),,通過機(jī)器合成特定 DNA 鏈實(shí)現(xiàn)寫入。
與運(yùn)行龐大且耗電量驚人的數(shù)據(jù)中心相比,DNA 存儲(chǔ)的優(yōu)勢(shì)顯而易見:它是三維空間存儲(chǔ),而非平面芯片,因此可實(shí)現(xiàn)極致的存儲(chǔ)密度;在保持干燥和低溫的條件下,DNA 可以穩(wěn)定保存數(shù)千年;此外,DNA 存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)維護(hù)幾乎不需要消耗電力,能耗極低。
現(xiàn)有 DNA 存儲(chǔ)需要將照片或視頻的數(shù)據(jù)序列,通過極其昂貴的機(jī)器“從頭合成(de novo synthesis)”出全新的 DNA 鏈。這種依賴酶促反應(yīng)的合成過程不僅成本高昂、操作復(fù)雜,而且數(shù)據(jù)一旦寫入,便無法更新或重復(fù)使用,這極大限制了其在日常高頻讀寫場(chǎng)景中的應(yīng)用。
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(來源:密蘇里大學(xué))
核心突破:無需合成的“移碼編碼”與可重寫機(jī)制
該研究的通訊作者、密蘇里大學(xué)工程學(xué)院化學(xué)與生物醫(yī)學(xué)工程教授顧立群指出:“DNA 是生命藍(lán)圖的絕佳載體,我們的目標(biāo)是讓它在分子層面實(shí)現(xiàn)更快、更簡(jiǎn)單、更高效的讀寫重寫。”
為了讓 DNA 存儲(chǔ)可發(fā)揮現(xiàn)代硬盤般的作用,密蘇里大學(xué)的研究人員開發(fā)出了一套無需從頭合成、無需酶促反應(yīng)的全新 DNA 記憶系統(tǒng)。其核心創(chuàng)新在于移碼編碼(Frameshift Encoding)的寫入方式,使用納米孔中斷解碼(Nanopore Duplex Interruption Decoding)進(jìn)行精準(zhǔn)讀取,以及最為關(guān)鍵的,通過立足點(diǎn)介導(dǎo)的鏈置換(Toehold-Mediated Strand Displacement):技術(shù)實(shí)現(xiàn)定點(diǎn)擦寫。
首先是移碼編碼技術(shù),研究團(tuán)隊(duì)的靈感來源于病毒的核糖體移碼現(xiàn)象。他們摒棄了傳統(tǒng)的“合成新 DNA 鏈”的做法,采用了一條通用長(zhǎng) DNA 單鏈作為“模板”,并在模板的預(yù)定位置上退火結(jié)合不同長(zhǎng)度的“微型短鏈”,以此來代表不同的數(shù)據(jù)位,編碼二進(jìn)制信息。
就像搭積木一樣,整個(gè)過程無需合成新 DNA 鏈、無需酶催化、無需任何標(biāo)記,直接實(shí)現(xiàn)了快速、低成本且并行的信息寫入。
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(來源:PNAS Nexus)
在數(shù)據(jù)讀取階段,研究團(tuán)隊(duì)使用了一種緊湊的分子級(jí)探測(cè)器——MspA 納米孔傳感器。當(dāng)帶有微型短鏈的 DNA 長(zhǎng)模板穿過這個(gè)極小的納米孔時(shí),雙鏈結(jié)構(gòu)會(huì)被物理“解開”。
在解開的過程中,DNA 會(huì)引產(chǎn)生獨(dú)特的電流阻斷信號(hào)。研究人員發(fā)現(xiàn)了一種新型的解鏈標(biāo)記,利用移碼引起的電流特征,讓軟件能夠精確解析出每一個(gè)數(shù)據(jù)位,從而實(shí)現(xiàn)高精度讀取。
最后是讓 DNA 變成“可重寫硬盤”的關(guān)鍵機(jī)制。由于數(shù)據(jù)是通過模板上的短雙鏈結(jié)構(gòu)來編碼的,研究人員利用立足點(diǎn)介導(dǎo)的鏈置換這一生化反應(yīng),可極其高效且精準(zhǔn)地將特定的微型短鏈“剝離”,替換為新的短鏈。這就意味著,用戶可以像在電腦上修改文檔一樣,針對(duì)特定比特進(jìn)行定向擦除和重寫。這一機(jī)制讓 DNA 真正具備了“硬盤級(jí)”可重寫能力。
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(來源:PNAS Nexus)
超高安全性與未來圖景:拇指大小的“分子 U 盤”
除了高容量和可重寫性,這種物理層面的分子存儲(chǔ)還帶來了可靠的安全屬性。因?yàn)?DNA 是一個(gè)離線的物理實(shí)體,無需像電子系統(tǒng)那樣時(shí)刻連接網(wǎng)絡(luò),天然具備極高的網(wǎng)絡(luò)安全防護(hù)能力,可完全避免黑客的遠(yuǎn)程攻擊,非常適合用于保護(hù)個(gè)人記憶、核心機(jī)密文件、科學(xué)數(shù)據(jù)以及企業(yè)檔案。顧立群教授將其形象地比作數(shù)字生活的“超級(jí)安全保險(xiǎn)箱”。
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圖 | Andrew Gu(來源:密蘇里大學(xué))
這項(xiàng)涵蓋了物理學(xué)、生物學(xué)、數(shù)據(jù)科學(xué)和材料科學(xué)的跨學(xué)科研究,在概念上證明了 DNA 作為高級(jí)信息技術(shù)媒介的潛力,還規(guī)劃了清晰的未來路線圖。
長(zhǎng)遠(yuǎn)來看,研究團(tuán)隊(duì)正在開發(fā)配套的緊湊型電子設(shè)備,希望將這種基于納米孔的讀取工具縮小到一個(gè) U 盤的大小。根據(jù)論文展望,這種可重寫的 DNA 存儲(chǔ)框架不僅能替代現(xiàn)有的高能耗存儲(chǔ)技術(shù),未來還有望跨界應(yīng)用于內(nèi)存計(jì)算、安全數(shù)據(jù)加密與解密,以及動(dòng)態(tài)生物分子傳感等前沿領(lǐng)域。
伴隨著這項(xiàng)技術(shù)的不斷優(yōu)化,或許在不久的將來,把全世界的數(shù)據(jù)裝進(jìn)口袋將成為我們?nèi)粘I畹囊徊糠帧?/p>
參考內(nèi)容:
https://showme.missouri.edu/2026/mizzou-researchers-developing-a-rewritable-dna-hard-drive/
https://techxplore.com/news/2026-03-rewritable-dna-hard-storage-crisis.html
https://academic.oup.com/pnasnexus/article/4/9/pgaf233/8248423
運(yùn)營(yíng)/排版:何晨龍
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