在波爾布特的步步緊逼下，索平自殺，韓桑林和洪森叛逃越南

1977年12月，越南集中14個師的兵力，包括五個精銳師，想通過速戰速決一舉拿下柬埔寨。
柬埔寨外交部隨即舉行記者招待會，宣讀和散發民柬政府的聲明。
聲明說，自1977年9月以來，越南就在柬埔寨進行了一系列大規模的入侵，派軍隊在邊境騷擾，搶奪將近上萬公頃的稻谷，燒毀森林、槍殺居民，焚燒民房，偷竊人民的財產和牲口，強奸婦女，真是比以前的阮文紹，阮高其和南朝鮮雇傭軍更甚。
就在喬森潘發表廣播講話的同時，越南軍隊已經在某些地方深入柬埔寨領土20公里，抵達了柴禎省。邊境線上激烈的戰斗持續了一個多星期，1978年1月6日，越南人開始撤軍。當這個消息傳到金邊時，正在為越南人的猛烈打擊坐臥不安的人們頓時松了一大口氣，電臺，報紙，雜志一起出動，歡呼這個“歷史性的偉大勝利。”
78年1月17日，波爾布特很豪邁的1講:“世界上大多數人都認為我們既然已經打敗了美帝國主義，那我們一定能夠打敗和消滅越南侵略者。”

越南對柬埔寨的這次越境入境，使黨的高層對越南人的陰謀提高了警惕，同時也對在國內和黨內存在的親越集團和親越情緒更加敏感。
S-21的主任康克由肩上的擔子更重了。在這次越南人的入侵中，與越南接壤的東部大區的部隊缺乏良好的表現，引起了黨內普遍不滿，同時來自S-21的報告也使波爾布特等人對東部大區的領導人產生了懷疑。當時東部大區的黨委書記是索平，一個從40年代起就投身于反對法國殖民主義統治斗爭的老黨員，他同時是柬共中央委員，并擔任僅次于喬森潘的國家主席團副主席。

根據1977年被捕的柬共中央黨校校長莫金龍的供詞，黨內的反對派一直在策劃政變，而這場政變指揮部就設在東部大區，當時權傾朝野的索平和他東部大區的那些各區、社的書記們都與這場政變有關。
在黨中央的秘密會議上，人們雖然沒有指名道姓，但已心照不宣的把目光轉向了索平和他的東部大區。
到1977年中期，索平的名字已經頻繁的出現在S-21人犯人的供詞中，他身邊的一些軍事指揮官和地方官員也開始遭到逮捕，對他的監視已經開始了。

1978年5月，一份被捕的東部大區軍事指揮官的供詞，終于導致高層下決心解決索平。一個名叫桑輝的軍官在他的供詞中說，從1977年起，東部大區的軍官們就已經開始策劃政變，準備在9月民間共產黨的生日那天對首都發起攻擊，按照桑輝的說法，索平是整個政變計劃的總指揮和協調人。
這份供詞在金邊看來很有說服力，因為他解釋了在反對越南人1977年12月份入境時柬埔寨軍隊抵抗無力的原因，波爾布特經過縝密考慮，決定對東部大區的政變陰謀進行鎮壓。
1978年5月下旬，大批從柬埔寨中部和其他地區調集的軍隊開始向東部開進，受到索平信任，參與政變活動的各級軍事指揮官和各級黨的干部，全部予以逮捕，一個月內整個東部大區的領導層基本都換上了新面孔。索平本人已經預見到他所面臨的災難結局，6月3日在押往監獄的路途上開槍自殺，避免了以后遭到更殘酷的對待，其他400名官員連同索平的妻兒老小被全部處決。
另一些與索平有著千絲萬縷聯系的軍官和黨的干部，在逮捕的槍口對準他們之前倉皇出逃，有的直接越境逃到了越南，尋求政治避難，其中就有當時任紅色高棉某師師長、省委書記，后來出任柬埔寨人民共和國主席的韓桑林和當時任紅色高棉某團團長，后來權傾柬埔寨朝野的不倒翁首相洪森。

一場慘絕人寰的內部大清洗、大屠殺，自上而下開始了。