單純皰疹病毒(HSV)為人群中感染率最高的致病DNA病毒之一,分為HSV-1與HSV-2兩種亞型。其中HSV-1主要引發口唇皰疹,也可導致眼部感染(皰疹性角膜炎)甚至致命性的中樞神經系統感染(皰疹性腦炎);HSV-2則以生殖器皰疹為主要病癥,并與新生兒感染及HIV傳播風險升高密切相關。現行臨床一線藥物(阿昔洛韋、伐昔洛韋及泛昔洛韋等)均通過競爭性抑制病毒DNA聚合酶而阻斷復制,然而該策略僅可縮短發作期1–2天,且在免疫抑制患者中耐藥株檢出率逐年上升。盡管2020年后上市的普瑞利韋(pritelivir)通過靶向解旋酶-引物酶復合體提供了新作用機制,但抗病毒譜與耐藥屏障仍有限,臨床亟需結構新穎、靶點獨特、可覆蓋耐藥株的下一代藥物。
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近日,西班牙馬德里自治大學Luis Menéndez-Arias教授聯合山東大學展鵬/劉新泳團隊在國際權威期刊《Advanced Science》(影響因子?:14.3,中科院1區Top期刊)上發表題為“Discovery of a Baloxavir-Inspired Endonuclease lnhibitor That Prevents Herpes Simplex Virus 1 Replication in Cell Culture and In Vivo”的研究論文。研究團隊作者以HSV-1末端酶(terminase)pUL15C亞基為切入點,借鑒已上市抗流感藥物巴洛沙韋酸(baloxavir acid)的螯合機制,運用“優勢結構再定位”策略,設計并合成了一系列多環吡啶酮衍生物,最終獲得高活性候選物LN-7。該化合物通過阻斷病毒DNA的切割與包裝,在細胞及動物層面均表現出顯著抗病毒活性,且對阿昔洛韋耐藥株保持敏感性,為首個針對HSV基因組包裝環節的抗病毒候選分子。
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HSV-1末端酶由pUL15、pUL28與pUL33三種亞基組成,是病毒將長串聯體DNA切割成單體并注入衣殼的“分子馬達”。其中,pUL15的C端(pUL15C)兼具核酸內切酶活性與序列特異性識別功能,其晶體結構(PDB code: 4IOX)顯示該域屬于金屬離子依賴性酶家族,催化核心通過雙金屬離子機制水解磷酸二酯鍵,與流感病毒PA核酸酶及HIV整合酶具有相似的拓撲特征。鑒于巴洛沙韋酸可螯合PA亞基的Mg2?/Mn2?從而阻斷cap-snatching過程,作者推測其多環吡啶酮母核亦可能移植至pUL15C抑制劑設計。保留母核金屬螯合核心并對下方三芳環系統進行結構優化,經兩輪“設計-合成-評價”循環,最終發現候選化合物LN-7。
為解析作用模式,研究團隊以HSV-1 pUL15C晶體結構(PDB code:4IOX)為模板,結合人巨細胞病毒同源蛋白pUL89C(PDB code: 6EY7)補充活性位點Mn2?離子,并通過分子動力學模擬重建缺失的603–613與686–704柔性環區,構建獲得LN-7–pUL15C復合物穩定模型。模擬結果顯示,LN-7的多環吡啶酮三羰基系統通過三個氧原子與Mn2?形成五元螯合環,同時其聯苯側鏈與Phe512及Arg695分別產生π-π堆積與陽離子-π相互作用,從而立體阻擋DNA底物進入催化中心。定點突變實驗進一步證實,F512A或R695A突變均導致酶活性喪失,提示上述殘基雖非底物接觸位點,卻通過“門控”機制調控抑制劑結合,為后續結構優化提供明確方向。
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藥代動力學與安全性評估表明,LN-7在雄性SD大鼠中口服吸收良好,絕對生物利用度為48.4 %,消除半衰期(t1/2,po = 5.54 h)與低血漿清除率(Cl < 5 mL·min?1·kg?1)支持一日一次給藥;組織分布容積(Vd > 2 L/kg)提示藥物可廣泛到達潛在潛伏部位。連續5天灌胃75 mg·kg-1·d-1的急性毒性實驗未觀察到動物死亡、體重下降或肝腎功能指標異常,主要臟器未見組織病理學改變,初步治療指數> 1000。體內藥效學采用BALB/c小鼠HSV-1全身感染模型,在預防性(感染前1 d給藥)與治療性(感染后2 h給藥)兩種方案下,LN-7均能將肺、腦及嗅球中的病毒滴度降低1–2 log??(p < 0.01),療效與等劑量阿昔洛韋相當;與阿昔洛韋聯合應用未出現毒性疊加,提示其具備單藥或聯合治療開發潛力。
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綜上,LN-7作為首個靶向HSV基因組包裝過程的小分子抑制劑,兼具明確的機制、良好的體外活性、藥代動力學特征、安全性及體內藥效,為HSV感染(尤其耐藥毒株感染)的治療提供新型候選藥物。本研究涉及的“優勢結構再定位”策略與針對新冠、猴痘、基孔肯雅病毒等新發與再發病毒藥物研發的首選策略——“老藥新用”(即,首先篩選已知的同家族病毒抑制劑)異曲同工,拓展了快速發現原創抗病毒藥物研發的新途徑。
Luis Menéndez-Arias教授與山東大學展鵬/劉新泳團隊在基于靶標(聚焦金屬酶)的抗病毒藥物研究領域具有長期的緊密合作,運用優勢結構聚焦庫構建與表型篩選發現多類高效低毒的HIV RNase H抑制劑,在Drug Resist Updat、Acta Pharm Sin B、Drug Discov Today、J Mol Biol、Chem Soc Rev等共同發表文章19篇,共同主編專著《Antiviral Drug Discovery and Development》,申報國際專利1項。
本研究是雙方前期合作的深化與拓展。西班牙馬德里自治大學博士研究生Sabina Andreu、山東大學博士后唐凱以及山東大學碩士研究生周加慧為第一作者。該工作得到國家重點研發計劃、山東實驗室項目等資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1002/advs.202508006
附:山東大學藥學院抗病毒藥物研發團隊招聘博士后啟事https://www.pharm.sdu.edu.cn/info/1051/20123.htm
編輯 老Q
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