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      歸國!頂尖科學家,全職加盟復旦大學

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      3月22日,TOP小編查詢復旦大學化學系官網發現,舒校坤已全職加盟復旦大學,擔任化學生物學教授、博導

      此前,校坤教授擔任美國加州大學舊金山分校(UCSF)藥物化學系終身正教授、心血管疾病研究所核心研究員、Helen Diller綜合癌癥研究中心成員。


      舒校坤教授簡介


      舒校坤,現任復旦大學相輝學者、特聘教授、“百利天恒”冠名教授、化學生物技術智能研究所iCOBRAInstitute ofChemical andOpen BiotechnologyResearch andApplication)創始所長。

      回國前擔任美國加州大學舊金山分校(UCSF)藥物化學系終身正教授、心血管疾病研究所核心研究員、Helen Diller綜合癌癥研究中心成員。曾獲美國國立衛生研究院主任新創新者獎(NIH Director’s New Innovator Award)及NIH MIRA等重量級獎項。

      舒校坤2000年畢業于四川大學獲得理論物理學士學位,2003年畢業于復旦大學獲得碩士學位(導師:蔣平教授、車靜光教授);2007年畢業于俄勒岡大學獲得生物物理博士學位(導師:Jim Remington教授)。

      舒校坤教授師承諾貝爾獎獲得者錢永健教授,自2010年起,他成為加州大學舊金山分校的獨立PI,并于2020年晉升為正教授。他在Science, Nature Methods, Nature Chemical Biology, Molecular Cell, JACS等頂尖期刊上發表多篇論文。

      近三年代表性學術論文及成就(創新性、影響力、與系統性)

      2023-2026以通訊作者在Nat. Struct. Mol. Biol., Nat. Chem. Biol., Nat. Microbiol., 和PNAS,ACS Cent. Sci. 等領域內頂級期刊和高水平綜合期刊上發表多篇具有重大影響力/里程碑學術論文。

      簡要總結:1)成像工具創新:基于熱力學理論(如Flory-Huggins Theory)開發了系列原創性分子探針及化學遺傳學工具,突破了對活細胞內信號傳導與生物大分子凝聚體高時空分辨成像與精準調控的技術瓶頸。2)疾病機制解析:首次解析了細胞信號與生物大分子相分離驅動腫瘤發生的底層分子機制,為理解復雜生命現象與重大疾病機制提供了物理化學視角。3)新靶點發現:基于上述原創機制,定義并驗證了多個具有轉化潛力的新型藥靶。4)臨床轉化:結合自研的原創工具,開展針對“不可成藥”靶點在內的新型藥靶的創制性藥物研發,打通了從基礎物理化學原理到臨床轉化應用的全鏈條。

      1) Li X+, Tan SK+, Chung CI+, Hatstat AK, Zhao Q, Luo J, DeGrado WF*,Shu X*. Design of an ultrabright biosensor for dynamic imaging of kinase activity in cells.Proc Natl Acad Sci U S A. 2026. In Press

      Innovation (創新): 基于熱力學原理并結合蛋白質從頭設計開發了激酶活性分子探針NOVARK,對活細胞內的激酶信號進行高時空分辨成像。

      Impact (影響): 為基于蛋白質從頭設計原理開發激酶活性探針鋪平了道路。這些探針可用于對活細胞內的激酶信號進行讀取,從而解析生命系統的運行邏輯。

      系統性:NOVARK激酶活性探針是對本課題組在2018年基于相分離熱力學原理設計的全新激酶活性探針SPARK (發表于Mol. Cell) 的一次最新拓展。這些激酶活性探針是我們在實現生命體內細胞信號網絡的高時空分辨成像工具開發方面系統性工作的一部分,其它還包括:1)蛋白酶活性探針,比如2015年開發的蛋白酶近紅外熒光探針iCasper (發表于PNAS);2018年開發的蛋白酶綠色熒光探針 FlipGFP (發表于JACS);

      2)蛋白質相互作用分子探針(見下一頁的系統性工作介紹)。

      2) Yang J+, Chung CI+, Koach J, Liu H, Navalkar A, He H, Ma Z, Zhao Q, Yang X, He L, Mittag T, Shen Y, Weiss WA,Shu X*. MYC phase separation selectively modulates the transcriptome.Nat Struct Mol Biol. 2024 May 29. PMID: 38811792 PMCID: PMC11479839

      Innovation (創新): 首次發現相分離本身對MYC靶向基因的調控具有高度選擇性,對癌細胞增殖起關鍵作用。

      Impact (影響): 定義并驗證了MYC相分離是一個全新的潛在藥物靶點,其優點是相分離抑制劑具有高度選擇性。由于MYC對70%腫瘤發生或發展、以及侵襲、轉移、耐藥、重塑腫瘤微環境、免疫逃逸密切相關,此發現對腫瘤分子機制研究具有重大指導意義,并且提出了針對“不可成藥”靶點藥物研發的新范式。

      系統性:此項工作,結合我們在致癌融合轉錄因子YAP-MAML2上的工作,共同揭示了相分離的全新生物學功能,加深了對生物大分子凝聚體及相分離在生理與病理過程中的作用機制理解,為研發“不可成藥”靶點藥物提供了全新理論依據。

      3) Li X, Combs D, Salaita K,Shu X*. Polarized activity of the focal adhesion kinase within single focal adhesions during cell migration.Nat. Chem.Biol. 2023 Jun 22

      Innovation (創新): 利用熱力學的相分離機制開發了基因編碼的黏著斑激酶(FAK)活性分子探針,能在活細胞和脊椎動物中可視化內源FAK 活性,并且具有高時空分辨率。首次揭示了 FAK在遷移細胞前緣高度極化的全新特點。

      Impact (影響): 闡明了 FAK 如何充當力學傳感器,在細胞遷移的黏著斑更新中扮演重要角色,對理解細胞遷移包括癌細胞在腫瘤中的遷移機制、及開發新型抑制劑具有重大指導意義。此探針對探索生命體運行的底層邏輯有重大價值。

      4) Chung CI, Yang J, Yang X, Liu H, Ma Z, Szulzewsky F, Holland EC, Shen Y,Shu X*. Phase separation of YAP-MAML2 differentially regulates the transcriptome.Proc Natl Acad Sci U S A. 2024. 121(7): e2310430121.

      Innovation (創新): 首次揭示致癌融合轉錄因子YAP-MAML2發生相分離并形成具有轉錄活性的生物大分子凝聚體。基于熱力學Flory-Huggins Theory,通過增加溶質與溶劑的相互作用,開發了可逆的化學遺傳學工具,發現相分離并非全面調控所有受控基因,而是高度選擇性地影響一小部分目標基因。

      Impact (影響): 加深了對生物分子凝聚體在基因轉錄中的作用理解,表明相分離在不同靶基因的選擇性調控中扮演獨特角色。

      系統性:此次研究開發的化學遺傳學工具 (SPARK-OFF),可以精準溶解轉錄因子凝聚體。SPARK-OFF是我們在實現對生命體內對生物大分子凝聚體相分離操控工具開發方面系統性工作的一部分,另一個與之互補的工具是SPARK-ON,可以精準誘導轉錄因子相分離,形成凝聚體。相較于傳統方法,我們工具的優勢是可以在不引入突變、且不改變蛋白質豐度情況下精準操控相分離,廣泛適用于生物大分子凝聚體的研究,對理解相分離的生物學功能具有重大意義。

      5) Chung CI, Yang J,Shu X*. Chemogenetic Minitool for Dissecting the Roles of Protein Phase Separation.ACS Cent Sci.2023 Jul 26; 9(7):1466-1479.

      Innovation (創新): 基于熱力學Flory-Huggins Theory,通過增加溶質與溶質相互作用,首次開發了能夠精準誘導特定蛋白質相分離的化學遺傳學工具(SPARK-ON), 用于探索生物分子凝聚物中相分離如何調節轉錄因子的基因轉錄活性。

      Impact (影響): SPARK-ON 可以在不引入突變、且不改變蛋白質豐度的情況下誘導相分離,為深入研究多種轉錄因子及其他生物分子凝聚物的相分離生物學功能提供了一個強有力的工具。克服了傳統研究相分離方法的致命缺陷-通常依賴突變,但突變往往會改變轉錄因子自身的活性,導致難以區分是相分離還是突變直接影響了轉錄。

      6) Yang J, Xiao Y, Lidsky PV, Wu CT, Bonser LR, Peng S, Garcia-Knight MA, Tassetto M, Chung CI, Li X, Nakayama T, Lee IT, Nayak JV, Ghias K, Hargett KL, Shoichet BK, Erle DJ, Jackson PK, Andino R*,Shu X*. Fluorogenic reporter enables identification of compounds that inhibit SARS-CoV-2.Nat Microbiol. 2023 Jan; 8(1):121-134.

      Innovation (創新): 基于全新三級結構的熒光蛋白UnaG(不同于GFP),開發了名為SURF的可逆的蛋白質-蛋白質相互作用熒光探針。證明SURF適用于高通量篩選,并成功發現了三種能阻斷病毒在小鼠模型中復制的天然化合物。

      Impact (影響): SURF系統首次能同時具有高時空分辨率、無須外源輔因子、由暗到亮熒光變化、能定量檢測蛋白質之間的相互作用強度、定量測量抑制劑的活性。已成功應用于篩選“不可成藥”靶點的抑制劑,包括MYC(未發表)。對在活細胞中研究蛋白質相互作用及開發抑制劑或結合劑具有重大應用價值。

      系統性:SURF是我們在設計蛋白互作分子探針方面系統性工作的最新進展,前幾項工作包括:1)2014年基于Singlet oxygen-mediated Triplet Energy Transfer原理的STET探針,突破了FRET在探測距離上的限制;2)2018年基于相分離原理設計的SPPIER (Separation of Phases-based Protein-protein Interaction Reporter) 探針,比其它基于GFP的探針在亮度上提升了10倍,而且其信號圖案極易檢測。

      編輯、審核:石瑾鵬

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