1939年率300人回睢杞太，兩月惡戰連連隊伍增至千人

1938年5月，日軍占領華中重鎮徐州后，沿隴海路向西進犯，河南面臨淪陷危機。在這危急關頭，中共河南省委派省委組織部長吳芝圃，以豫東特委書記身份，深入敵后，發動和領導該地區的抗日武裝斗爭。

5月下旬，在杞縣即將淪陷的前夕，吳芝圃只身回到闊別多年的家鄉杞縣趙村。

他回鄉后，利用人地兩熟的條件，奔走在睢杞大地的農村、學校和各界愛國人士間，廣泛發動群眾，團結各界愛國力量，加之睢、杞兩地黨組織先前已做了大量工作，在短時期內就組建起了一支200多人的抗日武裝。

1938年6月10日，睢杞兩縣的抗日戰士集合在杞縣大鄭莊的打麥場上，隊前架起6挺烏黑發亮的機槍。吳芝圃鄭重宣布“睢杞抗日游擊大隊”成立。他說，我們是中國共產黨領導的抗日武裝，我們的任務是開展抗日游擊戰爭，打擊敵人，保護人民。全體指戰員都要遵守三大紀律、八項注意。全大隊200多人，分為兩個中隊。

為了打擊日偽力量，擴大抗日游擊隊的影響，睢杞大隊決定消滅盤踞在睢縣長崗的漢奸民團張心貞部。該部勾結日軍、為害鄉里、無惡不作，尤其是在睢杞大隊成立后，為了對抗我抗日武裝，竟殘酷殺害我黨領導干部李省三，氣焰十分囂張。

6月24日，部隊在杞縣英王村召開了李省三烈士追悼大會，并作為戰前動員。吳芝圃悲憤地述說了李省三同志遇害經過和慘狀，敵人將其殺害后，還極其殘忍地將尸體斬首截肢，大卸八塊。

會后，戰士們悲憤填膺，個個臂纏白紗，揮淚奔赴前線。經過激戰，攻入寨內，張心貞等龜縮至一炮樓內，據險固守。為減少傷亡，吳芝圃下令圍而不攻。經過兩天圍困，敵人斷水缺糧，亂作一團。

張心貞派匪徒送信詐降。正當吳芝圃閱信時，匪徒掏出手槍對準了他，在這千鈞一發之際，一名戰士推倒吳芝圃，砰的一槍將匪徒打死。張心貞無計可施，帶殘部挖地洞逃竄，戰斗勝利結束。

此戰殲敵百余，繳槍400余支，子彈2000余發。戰斗結束后，吳芝圃率領部隊亮兵游行，群眾夾道歡呼，有人編兒歌唱道：“吳芝圃呱呱叫，打得張心貞喝馬尿，乘夜挖洞逃，老窩被端掉。”

長崗大捷之后，我黨領導的抗日武裝聲威大振，許多青年踴躍參加游擊隊，隊伍進一步壯大。為了統一領導和健全組織，1938年7月，吳芝圃在杞縣傅集召開睢、杞、太三縣黨組織和游擊隊負責人會議。

會議決定成立“豫東人民抗日游擊第三支隊”，司令員吳芝圃，副司令員王海山、孟海若，政治部主任王靜敏。支隊下轄3個大隊和1個特務中隊，約1800人。這支部隊，活躍在日偽統治下的豫東地區，與廣大人民群眾一起，屢屢給敵人以沉重打擊。

1938年9月，吳芝圃奉命率“三支隊”西進，與東進的彭雪楓部會師。至此結束了他在豫東地區初創抗日武裝的工作。

1938年9月中旬，中共河南省委根據中共中央和長江局“應將工作重心移向豫東，創造豫皖蘇魯邊新局面”的指示，令吳芝圃率“三支隊”西進，開往西華一帶待命。

時在確山縣竹溝鎮的彭雪楓，接周恩來9月29日“速去豫東開展游擊”急電，第二天即率領373人，誓師東進，于10月上旬，到達西華縣城，與吳芝圃率領的豫東人民抗日游擊第三支隊、蕭望東率領的新四軍游擊支隊先遣大隊會合。

10月11日，在西華城北的杜崗村召開會師大會，正式宣布這三支部隊合編為“新四軍游擊支隊”。彭雪楓任司令員兼政委，副司令員吳芝圃，參謀長張震，政治部主任蕭望東。10月12日，中共中央批準游擊支隊成立黨政軍委員會，以彭雪楓、吳芝圃、張震、蕭望東、岳夏為委員，彭雪楓為主席。從此，豫東敵后有了一支開展游擊戰爭的堅強武裝力量。

在合編后的游擊支隊中，大多數指戰員來自三支隊。其中有些干部、戰士存在著地方主義、山頭主義等錯誤傾向，吳芝圃從黨的利益出發，顧全大局，主動到他們中間做深入細致的政治思想工作，反復講明共產黨員必須無條件服從黨的決定和“黨指揮槍”的道理，以及加強團結、加強組織紀律性的重要意義。

他處處以身作則，維護黨的團結，保證了部隊整編工作的順利進行。受到了全支隊同志們的贊揚和尊敬。

部隊整編后，在淮陽與日軍作戰，取得首戰勝利。隨后向肖、宿、永、夏、碭挺進，逐步開辟了豫皖蘇抗日根據地。1939年1月，為了執行“擴軍、籌款、接干部”三大任務，吳芝圃奉命率領300多人二返睢杞太。在此期間，與敵偽進行了多次激烈的戰斗。

由于他人地兩熟，指揮自如，接連獲勝。其一戰荊崗，全殲偽匪李繼書300余人，繳獲大批彈藥物資；李的屬下曹德林率200余人投降接受整編；二戰大朱莊，俘獲偽匪朱子固，殲其部150余人；三戰尹店，殲偽匪劉志立400余人，繳獲重機槍2挺、輕機槍5挺、長短槍200多支，子彈6000余發。隨后又打了3仗，也都取得了重大勝利。

3月中旬，他率部與冀魯豫支隊司令員楊得志率領的部隊會師，迎接送來的130名干部。在淪陷區，八路軍與新四軍部隊勝利會師，士氣大振。稍后，兩支部隊在練城聯合作戰，殲滅偽頑郭德俊部千余人。次日，楊部在南機屯殲偽頑300余人后回師華北。

3月下旬在杞縣瓦崗，吳芝圃率部與日軍相遇，敵2000余人，坦克7輛，裝甲車14輛，汽車82輛，在敵我兵力和裝備極為懸殊的情況下，我軍頑強奮戰，激戰竟日，斃敵數十名后，破圍轉移。

次日，由于三大任務業已完成，吳芝圃率部返回新四軍游擊支隊駐地，受到彭雪楓司令員、張震參謀長等親自迎接。后來，以他這次帶回的千人隊伍為基礎，建立了第三團，成為支隊三大主力團之一。

由于吳芝圃在地方的巨大影響和他善于發動群眾，豫東人民把自己的子弟和物資一批一批地送到前線，補充我軍的兵員和給養，彭雪楓曾風趣地稱贊吳芝圃是“革命的老母雞”。

1939年8月，中共中央決定建立豫皖蘇邊區黨委，任命吳芝圃為邊區黨委書記和行署主任。在邊區黨委和游擊支隊的共同努力下，先后建立了永城、夏邑、肖縣、宿西、亳北等5個抗日縣政府，成立了各級群眾抗日組織，在打擊日軍、清除漢奸和發展生產、減租減息、改善人民生活等方面都取得很大成績。

至1940年7月，豫皖蘇根據地進一步擴大和鞏固，以永城為中心，東到皖東北，西抵睢杞太，北依隴海路，南至淮上廣大地區，活動范圍達50余縣。

在軍事方面，1940年1月30日，根據新四軍軍部命令，游擊支隊改番號為“新四軍第六支隊”，司令員彭雪楓，副司令員吳芝圃。全支隊已發展至17800人。

1940年4月，毛主席寫信表揚豫皖蘇黨委：“一年來，豫皖蘇邊區迅速得到發展，部隊和地方武裝不斷得到擴大，你們的工作很有起色，中央對你們取得的成績深表滿意。”

吳芝圃的政治思想工作極為出色，他以誠待人，以德感人，以理服人。

1940年夏初，吳芝圃隨新四軍第四師轉移至淮北蘇皖邊區，任新四軍四師政治部代理主任、主任，這一時期他以部隊的政治思想工作為主。

1942年反掃蕩結束后，針對當時存在的混亂思想，他在干部會上做了《共產黨員的享受觀》的報告，1943年6月，在邊區黨政軍干部大會上做《反對不良傾向，鏟除個人主義》的報告。

“他指出，毛主席政治軍事思想的特點就是調查研究，實事求是，從實際出發，就是把馬列主義同中國的實際相結合。吳芝圃同志這個報告，對于當時師直機關的整風起了很大的推動作用。”

十年后，在抗美援朝的戰場上，四師老同志張景華（時任志愿軍9兵團政治部宣傳部長）與曾在淮北工作過的朝鮮同志崔達彥巧遇。二位老戰友在回憶往事時，崔達彥還深情地講起當年聽吳芝圃做整風報告的情景，他還一直珍藏著記錄報告內容的筆記本。可見這些報告感人之深。

李波人還寫道：“大家更欽佩芝圃同志的高尚品德和情操。他艱苦樸素，平易近人……和人談話總是滿腔熱忱，誠摯坦率，層次分明。他那憨厚的面容，溫和的目光，總是那么令人愿意和他接近。沒有一個人看到他對同志發過脾氣，沒有一個人聽說過他罵過人。”

“他雖然不做基層思想政治工作，但同志們都愿意找他談心。同志們都說，不論多么調皮的干部，不論有多少牢騷話，組織部門說不服，到了芝圃同志面前，經過他的指點，就自然而然心平氣和地接受分配工作了。沒有一個人在他面前發牢騷、講怪話、耍花招，因為他總是以誠待人、以德感人、以理服人。”

1944年8月，吳芝圃與彭雪楓、張震率領新四軍四師一部，開往津浦路西，打擊日寇和偽頑，開辟和建立了淮北路西抗日根據地，下轄8個抗日民主縣政府，53個區，人口約200萬。吳芝圃任淮北路西地委書記，直至抗戰勝利。