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1月4日,譚蔚泓院士研究團隊接受媒體采訪
中國科學院院士、中國科學院杭州醫學研究所所長、浙江省腫瘤醫院院長譚蔚泓與吳芩研究員團隊合作取得重要突破,相關成果近日在線發表于國際學術期刊《Science》(第一作者:羅國焰博士后和宋佳副研究員)。這是浙江省腫瘤醫院首次以第一完成單位在《科學》期刊上發表研究成果,實現歷史性突破。
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研究團隊成功構建了全球首個能夠在單細胞分辨率下,同步實現細胞膜表面標志物發現與靶向核酸適體探針獲取的一體化平臺——SPARK-seq。該技術為分子識別、原創靶點發現及精準醫學研究提供了全新的強大工具,有望為眾多因靶點不明而缺乏有效療法的疾病(如三陰性乳腺癌)開辟全新的治療途徑。
細胞膜蛋白是藥物作用的關鍵靶點,而核酸適體是一類能夠高特異性、高親和力結合靶標分子的寡核苷酸,被譽為“化學抗體”,在疾病診斷與靶向治療中潛力巨大。然而,傳統的核酸適體篩選方法效率低、過程煩瑣,且難以在生理相關環境下系統發現全新的疾病標志物。
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1月4日,譚蔚泓院士研究團隊接受媒體采訪
SPARK-seq平臺的誕生,正是為了系統解決這一系列挑戰。相較于傳統方法,其篩選效率提升百倍以上,并能以前所未有的精度鎖定潛在的癌癥標志物與治療靶點。
譚蔚泓院士表示,研發SPARK-seq的初衷,是為了攻克像三陰性乳腺癌這類缺乏明確治療靶點的臨床難題。該平臺在單細胞層面部署的“分子雷達”,能夠大規模、并行地精準識別細胞表面與疾病相關的靶標,并同步獲取能特異性結合它的核酸適體探針。
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SPARK-seq原理與設計
SPARK-seq的工作原理清晰高效,主要分為三個關鍵步驟:
第一步,利用CRISPR基因編輯技術對大量癌細胞進行“微創手術”,精準剪掉特定的膜蛋白。
第二步,引入包含海量候選分子的核酸適體庫。
第三步,借助單細胞測序技術,為每個細胞拍攝“高清全景照”,在同一個細胞里同步讀取“誰被剪掉了”“細胞變了嗎”“誰結合上去了”關鍵信息。通過自主研發的新算法和大數據分析,SPARK-seq將細胞膜表面標志物的發現從“間接推測”轉變為可“直觀解讀”的數字信號。

SPARK-seq的強大之處在于,它首次在單細胞層面實現了從靶點發現到工具分子篩選的閉環。這相當于在精準識別疾病關鍵“靶標”的同時,也獲得了能夠干預它的特異性“鑰匙”。
團隊開發的數據分析新方法,有效破解了單細胞數據高維、稀疏背景下的信號提取難題,從而使得這一大規模、系統性的閉環發現成為可能。
SPARK-seq作為一個強大且自主可控的原創性平臺,為“無藥可靶”疾病的靶點研究與治療開發提供了全新范式與希望。它使得科研與臨床工作者能夠基于我國獨特的臨床資源,系統性地發現具有自主知識產權的新靶點與新工具。
未來,該技術有望推動形成一種“按圖索驥”式的精準醫療新模式,快速為不同疾病匹配或定制治療分子,極大提升藥物研發的效率和治療方案的精準度。
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“我們期待SPARK-seq能推動生物醫藥研發從傳統的經驗篩選,向數據驅動與智能設計的新范式演進。”譚蔚泓院士展望道,“未來,我們或許可以像根據藍圖建造房屋一樣,通過計算智能設計出自然界不存在的、性能卓越的新型靶向核酸藥物,讓更多患者早日受益于真正的精準治療方案。”
圖/文/編輯 宣傳統戰部
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