廣東
近日，中國農業大學、丹麥奧胡斯大學以及南京農業大學等單位的研究人員在Nature Communications期刊發表題為“Egg-laying ChickenGTEx resource deciphers context-specific regulatory effects on fertility traits”的研究成果。中國農業大學已畢業博士生、現丹麥奧胡斯大學博士后朱迪與南京農業大學史凱博士為本文共同第一作者。中國農業大學胡曉湘教授、丹麥奧胡斯大學房靈昭副教授以及南京農業大學馮春剛教授為本文共同通訊作者。
產蛋性狀（如開產日齡、產蛋數等）是蛋雞育種中最重要、也最典型的復雜性狀之一，其遺傳基礎往往涉及多組織、多通路與多時間尺度的共同作用。母雞群體產蛋周期通常可分為產蛋前期、產蛋高峰期與產蛋后期，不同階段在內分泌調控與生殖軸組織功能上呈現顯著差異，但相關組織在不同產蛋階段的基因表達與遺傳調控如何動態變化，長期缺乏系統性解析。另一關鍵挑戰是大量與繁殖相關的遺傳關聯位點位于基因組的非編碼區，雖然提示我們調控突變在其中發揮的重要功能，但目前仍缺少專注于母雞產蛋性狀的“遺傳變異—分子表型—復雜性狀”的可解釋鏈條，難以精準鎖定候選基因與作用組織和產蛋階段。為此，研究構建了具備統一采樣設計、配對基因組信息與多組織轉錄組數據的GTEx（Genotype-Tissue Expression）資源，并在產蛋階段這一關鍵生物學上下文中開展分層調控解析，明確了124個重要候選基因以及其發揮功能的組織、產蛋階段，為育種標記開發與功能驗證提供了系統化參考。同時研究揭示了繁殖性狀調控機制在鳥類和哺乳動物間跨物種的保守性。
雞產蛋階段GTEx項目流程示意圖
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