說到阿爾茨海默病(AD),大多數(shù)人可能會聯(lián)想到它的疾病癥狀,例如認(rèn)知、記憶功能衰退;又或者是一些病理特征,例如淀粉樣蛋白累積、tau蛋白神經(jīng)纏結(jié)。然而,在這些可觀察或檢測到的特征出現(xiàn)之前,大腦細(xì)胞中的基因表達(dá)已經(jīng)悄然發(fā)生了改變。
盡管大腦細(xì)胞的DNA序列幾乎是終生不變的,但哪些基因被“打開”或“關(guān)閉”,卻可以被環(huán)境和狀態(tài)變化所調(diào)控。這種不改變DNA序列、卻能影響基因表達(dá)的機(jī)制,也稱作表觀遺傳調(diào)控。近日,《細(xì)胞》雜志一項新研究在基因?qū)用胬L制了大腦細(xì)胞的復(fù)雜表達(dá)圖譜。研究發(fā)現(xiàn)大腦區(qū)域中脆弱細(xì)胞的細(xì)胞核會經(jīng)歷“崩潰”事件,導(dǎo)致失去對基因表達(dá)開放或關(guān)閉的調(diào)控能力。另外,細(xì)胞還會產(chǎn)生一些表觀遺傳信息丟失現(xiàn)象,打亂原本的基因調(diào)控模式。
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研究中,作者整合了來自111位捐贈者的384個大腦樣本的分析數(shù)據(jù)。分析區(qū)域涵蓋來自六個腦區(qū)的350萬個細(xì)胞,其中包括內(nèi)嗅皮層、海馬體、前丘腦等重點關(guān)注腦區(qū)。
根據(jù)這一高分辨率基因圖譜,研究團(tuán)隊在晚期AD樣本中發(fā)現(xiàn)一種普遍現(xiàn)象:染色質(zhì)區(qū)室化受損——本應(yīng)處于壓縮狀態(tài)的異染色質(zhì)區(qū)域出現(xiàn)開放;本應(yīng)活躍的常染色質(zhì)區(qū)域反而關(guān)閉。這些變化在AD發(fā)生后,最先出現(xiàn)損傷的內(nèi)嗅皮層和海馬體中最為明顯。
進(jìn)一步,作者引入“表觀遺傳信息”(epigenomic information)這一量化指標(biāo),用于判斷開放染色質(zhì)信號的富集程度。結(jié)果顯示,所有細(xì)胞類型在晚期AD中均出現(xiàn)信息丟失,其中興奮性神經(jīng)元、少突膠質(zhì)細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞最為嚴(yán)重。
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▲研究示意圖(圖片來源:參考資料[1])
研究者指出,當(dāng)表觀基因組條件惡化時,會為許多與疾病相關(guān)的基因表達(dá)打開大門;而如果細(xì)胞能夠保持其表觀基因組秩序,它們就能控制住與疾病相關(guān)的基因。此外,研究人員發(fā)現(xiàn)當(dāng)表觀基因組崩潰發(fā)生時,大腦會逐漸喪失認(rèn)知能力。
舉例來說,
APOE4基因被認(rèn)為是AD發(fā)生的重大遺傳風(fēng)險因素。而在
APOE4大腦樣本中,小膠質(zhì)細(xì)胞最初對疾病病理變化產(chǎn)生響應(yīng),表現(xiàn)出表觀基因組信息的增加。這代表它們在努力阻止疾病癥狀的蔓延。但隨著疾病進(jìn)展,這些細(xì)胞的表觀基因組信息開始急劇丟失,這是癥狀惡化和細(xì)胞變性的明顯跡象。這種轉(zhuǎn)變在擁有兩個APOE4拷貝的個體中非常明顯。
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圖片來源:123RF
另一個例子是表達(dá)
RELN基因及其蛋白Reelin的神經(jīng)元。在AD發(fā)生與發(fā)展中,內(nèi)嗅皮層和海馬體中表達(dá)
RELN的神經(jīng)元特別脆弱,但如果它們能夠存活下來則有望幫助促進(jìn)恢復(fù)認(rèn)知能力。這項新研究發(fā)現(xiàn),這些神經(jīng)元隨著疾病進(jìn)展表現(xiàn)出嚴(yán)重的表觀基因組信息丟失。但在保持認(rèn)知恢復(fù)力的人中,這些神經(jīng)元維持了表觀基因組信息穩(wěn)定
新研究的這些發(fā)現(xiàn)表明,表觀遺傳信息穩(wěn)定性不僅是AD病理進(jìn)展的伴隨現(xiàn)象,更是決定個體能否維持認(rèn)知功能的關(guān)鍵因素。研究為后續(xù)AD干預(yù)策略研究提供了新方向,例如針對易損細(xì)胞亞型開發(fā)表觀遺傳保護(hù)療法;或以表觀遺傳信息為生物標(biāo)志物,開展早期診斷與療效監(jiān)測。
參考資料:
[1] Single-cell multiregion epigenomic rewiring in Alzheimer’s disease progression and cognitive resilience. Cell (2025). DOI: 10.1016/j.cell.2025.06.031 External Link
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