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編輯丨coisini
今年早些時候,谷歌聯合耶魯大學等證實生物模型與自然語言處理類似,同樣遵循擴展定律:模型規模越大,在生物學任務中的表現就越出色。
這引出了一個關鍵問題:擴大模型規模僅能提升現有任務性能,還是能催生全新能力?谷歌認為:規模化的真正價值在于創造新思路、探索未知領域。
現在,谷歌聯合耶魯大學等正式發布 Cell2Sentence-Scale 27B(C2S-Scale 27B)。這個擁有 270 億參數的新基礎模型基于 Gemma 開源模型構建,旨在解讀單個細胞的「語言」,標志著單細胞分析領域邁入新前沿。
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論文地址:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.04.14.648850v2
模型地址:https://huggingface.co/vandijklab/C2S-Scale-Gemma-2-27B
項目地址:https://github.com/vandijklab/cell2sentence
C2S-Scale 針對癌細胞行為提出了創新性假設,研究團隊通過活體細胞實驗驗證了其預測準確性。
谷歌 CEO 桑達爾?皮查伊(Sundar Pichai)發推稱贊道:「C2S-Scale 為癌癥治療提供了全新可能路徑。」此次發布是人工智能在科學領域的重要里程碑。
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C2S-Scale 27B 技術原理
癌癥免疫治療面臨的核心難題在于許多腫瘤屬于「冷腫瘤」,即無法被人體免疫系統識別。使其轉化為「熱腫瘤」的關鍵策略是通過「抗原呈遞」過程,迫使腫瘤細胞展示免疫觸發信號。
研究團隊賦予 C2S-Scale 27B 模型一項特殊任務:尋找能作為條件放大器的藥物 —— 僅在特定「免疫環境陽性」條件下(即已存在低水平干擾素但不足以獨立誘導抗原呈遞的環境)增強免疫信號。
這需要模型具備條件推理能力,而這種能力正是模型規模擴展后涌現的新特性 —— 小規模模型無法解析這種環境依賴效應。
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為了實現上述目標,研究團隊設計了雙環境虛擬篩選方案來捕捉特定協同效應。該虛擬篩選包含兩個階段:
- 免疫環境陽性:向模型提供具有完整腫瘤 - 免疫相互作用及低水平干擾素信號的真實患者樣本;
- 免疫環境中性:向模型提供無免疫背景的孤立細胞系數據。
研究團隊模擬了 4000 多種藥物在兩種環境下的作用,要求模型預測哪些藥物僅在第一種環境中能增強抗原呈遞,使篩選更貼近臨床相關場景。
值得注意的是,在模型篩選出的候選藥物中,部分(10-30%)在既往文獻中有所記載,其余則是令人驚訝的新發現 —— 此前與篩查目標并無已知關聯。
從預測到實驗驗證
模型的預測結果非常明確:它發現 CK2 激酶抑制劑 CX-4945 存在顯著的「環境分化效應」。模型預測該藥物在「免疫環境陽性」條件下能強力增強抗原呈遞,而在「免疫環境中性」條件下幾乎無效。
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這一預測的創新性令人振奮:盡管 CK2 已知參與多種細胞功能(包括免疫調節),但文獻從未報道過 CX-4945 通過抑制 CK2 來顯著增強 MHC-I 表達或抗原呈遞。這表明模型正在生成可驗證的新假設,而非簡單復述已知事實。
研究團隊將假設帶入實驗室,在人類神經內分泌細胞模型(模型訓練時未接觸過的細胞類型)中進行測試。實驗結果證實:
- 單獨使用 CX-4945 對抗原呈遞(MHC-I)無影響
- 單獨使用低劑量干擾素僅產生有限效果
- 聯合使用 CX-4945 與低劑量干擾素可產生顯著的協同放大效應
值得注意的是,實驗室測試中聯合療法使抗原呈遞提升約 50%,這將顯著增強腫瘤的免疫系統可見度。
模型的預測在體外實驗中多次得到驗證。C2S-Scale 成功識別出新型干擾素條件放大器,為「冷」腫瘤轉化為「熱」腫瘤揭示了潛在新路徑,有望提升免疫療法響應率。盡管這僅是初步突破,但 C2S-Scale 為開發新型聯合療法提供了經實驗驗證的重要線索。
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此項成果同時構建了生物發現的新范式:遵循擴展定律構建如 C2S-Scale 27B 的大型模型,能創建足以運行高通量虛擬篩選的細胞行為預測系統,發現環境條件化生物機制,并生成基于生物學的可靠假設。
感興趣的讀者可以閱讀論文原文,了解更多研究內容。
參考內容:
https://x.com/sundarpichai/status/1978507110477332582
https://blog.google/technology/ai/google-gemma-ai-cancer-therapy-discovery/
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