生信女神劉小樂團隊！TIMER3重磅升級

在腫瘤免疫分析中，表達差異和生存分析是前提(表達有差異，差異影響表型)，相關分析是拓展，包括與病理分期、治療手段、年齡、種族、吸煙、突變、性別、共表達等因素的相關情況。免疫浸潤是近些年的熱點，從2018年免疫治療獲得諾獎，到2025年外周免疫抑制獲得諾獎，熱度不減。隨著免疫研究的不斷延伸、拓展，免疫和生信分析相互成就，助推生信和免疫研究更上一層樓。

純生信21天教程（可以操作的腫瘤免疫學）

在進行某個基因的免疫分析時，有的果朋友無從下手，主要是因為對腫瘤免疫認識不足。因此，做免疫分析前，務必掌握腫瘤微環境和腫瘤免疫循環等概念，否則一頭霧水，或者斷章取義。免疫系統在腫瘤發生、發展和治療中都起著至關重要的作用。隨著大數據時代的到來，對腫瘤免疫特征進行綜合分析日臻成熟，這方面的代表包括張澤民、劉小樂等。

網址: https://cistrome.shinyapps.io/timer/

TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)算法用常規轉錄組測序的數據分析常見各種免疫細胞在腫瘤微環境的浸潤情況，TIMER2.0版本更是將內容條理化。好消息傳來，，TIMER也升級到3.0。

網址：https://compbio.cn/timer3/

腫瘤的差異分析

生存分析

突變分析

相關分析（基于表達）

富集分析

免疫分析，與免疫細胞浸潤之間的關系

免疫預后分析

免疫治療響應與表達分析

免疫治療的差異分析火山圖和表格

免疫治療預后分析

免疫治療預測分析

個性化分析，需要上傳清潔數據

作者是李太文博士，四川大學華西口腔醫學院口腔基礎醫學系碩導，生信大牛劉雪莉教授的博后，以第一作者參與TIMER、TIMER2.0、TISCH、TISCH2.0和HUSCH等在線平臺的開發。，李太文博士則回到母校，創建自己的實驗室。期待這對師徒繼續書寫傳奇！

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