0實驗發一區，趕緊來吃泛基因家族的紅利！

低成本SCI思路王者--基因家族分析與泛基因家族分析合體了！

有參考基因組的物種就能發SCI！

生信分析+小實驗發二區，滿配實驗沖一區，基因家族分析的適用性無與倫比；泛基因家族分析更是無實驗穩發2區，工作量大可沖一區，有泛基因組的物種就能發。今天魚和熊掌終于可以兼得了！

參加組學大講堂《泛基因家族+基因家族分析實操》直播課程（范例數據、代碼、分析用鏡像永久免費，贈送3個月云服務器，2年超長售后），3天時間掌握分析技能，助你實現SCI自由，想發幾區發幾區！

開班時間：2025年12月10日-12月13日，4天

上課方式：組學大講堂網校直播

掃描下方二維碼即可報名：

更多問題可以加微信“532812110”聯系周老師進行咨詢！

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課程內容及優勢

組學大講堂是國內領先的生物信息培訓機構，已培訓學員近100000人，僅基因家族分析實操班已成功舉辦30+期，經驗豐富。本課程有如下優勢：

優勢1：內容全面：涵蓋一區、二區文章常用分析條目，一課掌握核心技能

優勢2：零基礎友好：針對初學者設計，分析代碼封裝，數據整理完善，復制粘貼即可上手

優勢3：環境一致：采用docker虛擬機教學（國內首創），無需安裝配置，學習即實戰

優勢4：硬件要求低：云服務器教學，指令發送由服務器處理，個人電腦可正常辦公

優勢5：售后無憂：2年超長時間售后答疑，學習全程無憂

優勢6：圖表高顏值：緊跟文獻最新趨勢，使用最新R包繪圖，生成高顏值、信息量豐富的圖表，直接用于文章撰寫

課程內容：

第一節：基因家族介紹

1.基因家族相關概念介紹

2.基因家族分析文章解讀

3.基因家族常規分析總結及高分文章思路

第二節：Linux入門學習與生信環境搭建

1.Linux系統簡介（bash，內核，命令行界面等）

2.Linux基礎命令學習（cd、ls、awk、grep、sed等）

3.介紹Docker運行原理、學習鏡像使用、容器管理相關命令

4.利用Docker鏡像搭建生信分析環境

第三節：基因家族成員鑒定

1.以擬南芥物種為例，鑒定WRKY基因家族成員

2.學習從數據庫網站（NCBI、Ensembl、JGI等）下載物種基因組，并進行數據處理

3.學習不同的鑒定方法（Hmmsearch、Blastp）

4.對鑒定結果在在線數據庫二次確認（pfam，CDD，SMART）

第四節：基因家族成員遺傳進化分析及基因結構分析

1.基于鑒定成員序列構建家族成員進化樹（iqtree2、MEGA）

2.使用iTOL對進化樹進行高級美化（文字及樹枝顏色大小、分組標記等）

3.使用生信軟件繪制基因結構圖、染色體定位圖

4.學習保守基序分析、順式作用元件分析

第五節：物種內基因加倍與串聯重復分析和物種間進化關系分析

1.借助MCScanX鑒定物種內大片段復制基因對和串聯重復基因對

2.使用circos軟件繪制出精美圈圖

3.進行基因選擇壓力KaKs分析，估算分化時間

4.基因家族成員在不同物種間進化關系分析（JCVI以擬南芥和白菜物種為例，鑒定物種間的共線性區塊和WRKY基因對）

5.對多個物種共線性分析發現保守基因

6.多物種共線性分析結果繪圖并美化排版

第六節：基因家族成員表達模式分析

1.對轉錄組數據搜索篩選

2.基因家族基因不同發育階段不同部位表達熱圖展示

第七節：基因家族蛋白互作網絡分析

1.STRING獲取成員蛋白序列之間互作關系

2.Cytoscape繪制蛋白互作網絡圖

第八節：基因家族蛋白結構分析

1.基于同源建模方法預測蛋白3D結構

2.繪制蛋白結構域多序列比對圖（保守結構域展示）

3.預測蛋白序列的亞細胞定位

第九節：泛基因家族成員鑒定

1.以擬南芥物種泛基因組數據為例，鑒定WRKY基因家族成員

2.學習從數據庫網站下載物種泛基因組，并進行數據預處理

3.hmmer結構域檢索，鑒定泛基因家族成員

4.對鑒定結果在在線數據庫二次確認（pfam，CDD，SMART）

5.泛基因家族成員序列提取（CDS序列、蛋白質全長序列、結構域序列）

第十節：泛基因家族成員PAV分析

1.泛基因列表構建（jcvi鑒定同源區段）

2.泛基因家族成員存在缺失PAV分析，結果可視化（繪制存在缺失熱圖）

第十一節：泛基因家族成員系統發育和選擇壓力分析

1.泛基因家族成員系統發育樹構建（iqtree，采用最大似然法，根據蛋白質全長序列或結構域序列構樹）

2.泛基因家族成員選擇壓力分析，結果可視化展示（繪制各基因Ka/Ks密度分布圖、kaks>1的基因在不同基因組中頻率分布的熱圖）

第十二節：泛基因家族成員結構變異相關分析

1.結構變異結果文件和基因表達量列表數據下載、格式解讀

2.ANNOVAR對結構變異進行基因注釋

3.提取泛基因家族結構變異基因

4.泛基因家族成員表達量和結構變異相關性分析

5.篩選表達量顯著改變的候選家族成員，繪制柱狀圖

6.候選家族成員的基因結構和motif分析（候選基因的基因結構和motif分析）

7.分析結構變異對泛基因家族保守結構域的影響（篩選具有最多結構變異泛基因家族成員的基因組，分析保守結構域）

第十三節：文章差異表達分析結果可視化

1.根據文章的差異表達分析(DEG)結果，繪制熱圖

2.差異表達泛基因家族成員與轉錄因子之間的共表達網絡繪制（使用Cytoscape工具進行基礎的網絡圖繪制）

本期課表

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常見問題解答

1. 集中4天培訓是否可以學完這么多內容？

答：經過多年課程優化，盡量合并操作環節，分析代碼已經封裝好，整理好數據，復制粘貼即可分析自己的數據，大大降低了分析難度，4天完全可以學完以上分析內容。

2. 培訓后提供回放嗎？

答：培訓結束，不是學習的結束，課后可以獲得對應線上錄播視頻課程，兩年內不限次觀看。分析所用軟件、代碼、課件、筆記均會提供，另外贈送組學大講堂云服務器3個月的使用權限，學員課后仍可方便的進行練習。

3. 培訓的時候是在云服務器上，如果換了設備，分析步驟還一樣嗎？

答：組學大講堂培訓采用先進的docker虛擬機，無論在什么設備上，凡是使用我們提供的鏡像，均可保持一致的操作環境，真正做到怎么學就怎么用。

4. 能否提供發票？

答：由北京組學生物科技有限公司提供正規發票。

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培訓時間、地點及費用

舉辦時間：2025年12月10日-12月3日（線上直播+2年不限次數回放）

舉辦地點：組學大講堂網校

培訓費用：原價3480元/人，限時優惠2980元/人

優惠信息：

① 團報優惠：2人及以上同時報名，額外優惠200元/人

②贈送組學大講堂云服務器3個月使用權

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報名方式

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測序、數據分析、課程培訓等事宜請聯系郵箱：Tech@biomics.com.cn