廣東
近日，廣東省農科院果樹所在Horticulture Research期刊上發(fā)表題為“The pangenome enhances the understanding of the genetic diversity of papaya”的研究成果。果樹所楊敏副研究員、周陳平副研究員為論文共同第一作者，楊敏副研究員和魏岳榮研究員為論文共同通訊作者。
該研究通過整合多個番木瓜資源基因組構建泛基因組，重點開展四方面研究：（1）構建同源基因、圖形、線性三種泛基因組并比較，互補揭示番木瓜基因組變異全景，發(fā)現非核心基因與品種抗性、風味相關；（2）挖掘到T3品種RRG基因內含子區(qū)94 bp缺失變異，首次在番木瓜中揭示該基因通過調控根分生組織細胞增殖與伸長影響根長的分子機制；（3）利用222份種質重測序數據鑒定26173個高可信結構變異（SV），發(fā)現其可揭示SNP分析未捕捉的遺傳關系，鑒定出馴化相關候選基因；（4）新增3個關鍵番木瓜品種（貯豐、T3和T5）及重新組裝的紫暉品種高質量基因組，豐富了番木瓜基因組資源。
泛基因組分析鑒定到的功能基因結構變異（SVs）
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