為什么你和我免疫力不同？《Cell》揭秘：腸道菌群在悄悄“編程”

人體免疫系統具有高度的多樣性，其中大部分差異源于非遺傳因素。腸道微生物群對免疫系統有著至關重要的影響；然而，其與健康人體基本免疫狀態之間的關系仍不完全清楚。

2026年3月9日，加利福尼亞大學舊金山分校Matthew H. Spitzer團隊在Cell在線發表題為“Immune-microbiome coordination defines interferon setpoints in healthy humans”的研究論文，該研究通過“免疫微生物組”研究對 110 名健康參與者進行了多組學分析。

基于因素的整合方法發現了協調變化，結果表明干擾素反應是健康參與者中最具變異性的一種免疫特征。微生物群組成、通路和糞便代謝物會與干擾素反應通路同時發生變化。跨越超過一年的縱向數據表明，這些參數在個體之間隨著時間的推移具有顯著的穩定性。總之，該研究提供了大量數據，用于研究健康個體在穩定狀態下免疫狀態與微生物群之間的關系，這為闡明與疾病易感性和對治療的反應相關的個體間差異鋪平了道路。

個體間的免疫差異對人類健康和疾病有著廣泛的影響。相關人群研究已經開始探尋免疫差異的驅動因素，結果表明環境因素可能比遺傳因素的影響更大。更深入的理解可能會為疾病易感性、嚴重程度以及對免疫調節療法（包括疫苗接種、癌癥免疫療法以及自身免疫性疾病免疫抑制治療）的反應性變化提供見解。

腸道微生物群能夠影響免疫反應。在癌癥患者中，微生物群的特征與臨床結果以及檢查點抑制劑免疫療法的效果相關聯。在自身免疫性疾病中，微生物群以及共生微生物產生的代謝物會影響治療反應。在疫苗接種中，微生物群可以作為佐劑，增強免疫原性。這些研究表明，微生物群及其產生的分子可能塑造患者的基線免疫狀態，并影響對治療的免疫反應。動物模型已經揭示了微生物群與免疫細胞發育和活動之間的因果關系。然而，健康人體在穩定狀態下微生物群特征與免疫狀態的差異之間的關系仍不完全清楚。

一個例子是對于基線或持續性干擾素（IFN）信號傳導的調控。這可以從缺乏微生物組的小鼠中 IFN 刺激基因（ISGs）表達的降低以及抗病毒免疫反應的受損中得到證明。實際上，在體內平衡狀態下，IFN 的產生量較低，而對 IFN 的感知會導致持續的信號傳導，這對于抗菌免疫反應以及塑造免疫環境和免疫活動至關重要。至于這種 IFN 信號在健康人類中的變化情況，以及它是否與人類腸道微生物組有關，目前仍不完全清楚。

文章模式圖（圖源自Cell）

該研究對健康個體之間的免疫學差異進行了研究，并探究了微生物組特征是否與這些免疫狀態有關。該研究生成了免疫系統、微生物組和代謝組的多模態數據，作為該領域的研究資源。該研究采用基于因子的整合分析來捕捉隊列中相互變化的特征，并在健康個體中確定了兩個主要的免疫變異性軸，涉及 IFN 反應程序。其中一個軸與腸道微生物組特征相關，而另一個則獨立于前者。

與變異相關的微生物組軸特別捕捉到了 IFN 反應基因表達以及 SIGLEC-1high表達單核細胞、激活的記憶 T 細胞亞群、激活的 CD69high表達自然殺傷（NK）細胞和黏膜相關不變 T（MAIT）細胞的豐度和表型的差異。將這些特征應用于公共數據集表明，與微生物組相關的 IFN 特征與增強的疫苗反應以及治療相關的癌癥免疫治療反應有關。此外，這些特征在同一個人身上會隨著時間的推移保持穩定，這有助于我們更好地理解健康人體內的免疫系統和微生物組的設定值。

參考消息：

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00168-6