近日,安徽省農科院蔬菜所西甜瓜創新團隊在《Theoretical and Applied Genetics》期刊發表題為“Map-based cloning and functional validation of ClChlH governing yellow rind color in watermelon (Citrullus lanatus)”的研究成果。安徽省農科院蔬菜所為論文第一完成單位,孟永嬌博士后和丁強強助理研究員為第一作者,嚴從生研究員和鄭州果樹所劉文革研究員為共同通訊作者。
該研究利用傳統正向遺傳學方法,圖位克隆得到調控西瓜黃色果皮關鍵候選基因ClChlH,并通過CRISPR/Cas9編輯技術驗證了該基因的功能,為未來特色西瓜育種提供了編輯靶點。
研究利用西瓜黃色果皮母本W-21-4-2與兩個綠色果皮父本W-21-301和W-21-129構建得到兩個遺傳定位群體,統計分析發現黃色果皮性狀分離比符合3:1,證明西瓜黃色果皮是單基因控制的顯性性狀,并將黃色果皮基因精細定位在Chr4:0-325.37 Kb。鑒定得到候選基因ClChlH (Cla97C04G068530),該基因編碼鎂離子螯合酶H亞基蛋白,是葉綠素合成途徑中的關鍵基因。在W-21-4-2中,ClChlH的CDS區域存在1處同義突變,啟動子區域存在7處變異,包括3個SNP和4個InDel。該基因在W-21-4-2中表達水平顯著下調,并表現出組織特異性表達,主要于果皮、葉片和葉柄中表達;證明了啟動子區域的變異是導致其表達下調的重要原因。此外,W-21-4-2中葉綠素積累量明顯減少,葉綠體發育不良。
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圖1 西瓜黃色果皮基因精細定位
論文鏈接:
https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-025-05087-4
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