近日,華南農業大學資源環境學院仇榮亮教授團隊在Nature Communications期刊發表題為“Potentiators empower synthetic microbiomes as silent guardians against co-contamination”的研究成果。華南農業大學資源環境學院副教授阮哲璞和博士生譚家霖為該論文的共同第一作者,仇榮亮教授為通訊作者。
仇榮亮教授團隊基于自主研發的基因組尺度代謝模型工具SuperCC,系統模擬了由多株關鍵功能菌組成的合成菌群在單一污染物與復合污染條件下的代謝行為,深入解析了污染物—菌株—代謝網絡之間的互作機制。
研究通過整合多組學數據與代謝建模分析,揭示了復合污染脅迫下菌群協同作用的關鍵驅動機制。結果表明,具有廣譜資源利用能力的菌株通過分泌特異性代謝產物,在群落中發揮“增效”作用,是促進菌群協同降解的重要物質基礎,不僅僅提高整個群落的生物量,還增強了菌群的降解功能;同時,本土關鍵菌株在維持群落結構穩定性和功能持續性方面具有不可替代的核心作用。在此基礎上,研究創新性提出了“降解菌—輔助菌—增效菌”協同構建的合成菌群設計范式(DHP-Com),顯著提升了合成微生物組在多類型復合污染場景下的修復效率與生態適應性。
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合成微生物組的多環境條件模擬與互養作用分析
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