在新冠病毒(SARS-CoV-2)持續(xù)變異的背景下,尋找具有新作用機制的抗病毒靶點成為全球藥物研發(fā)的關(guān)鍵方向。11月3日,浙江大學(xué)藥學(xué)院謝偉/董曉武課題組、復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院張榮課題組等聯(lián)合團(tuán)隊在 《Nature Communications》 在線發(fā)表了題為“SARS-CoV-2 NSP14 inhibitor exhibits potent antiviral activity and reverses NSP14-driven host modulation”的研究論文。該研究鑒定出一種高效、選擇性強的非核苷類NSP14甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑C10,不僅表現(xiàn)出卓越的抗新冠病毒活性,還揭示了NSP14在宿主轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的新機制,為抗新冠藥物研發(fā)提供了新的思路和候選化合物。
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NSP14:病毒復(fù)制與免疫逃逸的關(guān)鍵酶
SARS-CoV-2的非結(jié)構(gòu)蛋白NSP14是一種雙功能酶,由N端3′–5′外切核酸酶(ExoN)和C端N7-鳥苷甲基轉(zhuǎn)移酶(N7-MTase)兩部分組成。前者在病毒RNA復(fù)制中執(zhí)行“校對”功能,后者則負(fù)責(zé)催化病毒RNA帽結(jié)構(gòu)(RNA cap)的N7位甲基化,使病毒mRNA模擬宿主信使RNA,從而逃避免疫識別并促進(jìn)復(fù)制。先前研究表明,NSP14的兩個結(jié)構(gòu)域功能相互依賴,其活性缺陷會顯著削弱病毒增殖能力,因此NSP14被認(rèn)為是冠狀病毒復(fù)制中不可或缺的核心靶點。
然而,與SARS-CoV-2主蛋白酶(Mpro)或RNA依賴性RNA聚合酶(RdRp)相比,NSP14的藥物開發(fā)仍處于早期階段。已有報道的核苷類似物型抑制劑在細(xì)胞體系中效果有限,而非核苷類化合物普遍存在靶點選擇性不足的問題。因此,開發(fā)一種高效、選擇性強且具備細(xì)胞及動物模型活性的NSP14抑制劑具有重要意義。
發(fā)現(xiàn)高效非核苷類NSP14抑制劑C10
研究團(tuán)隊通過結(jié)構(gòu)導(dǎo)向藥物篩選與藥化設(shè)計改造,發(fā)現(xiàn)化合物C10能特異性結(jié)合于NSP14的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)結(jié)合口袋,并以高親和力抑制其N7-MTase活性。與人源甲基轉(zhuǎn)移酶的結(jié)構(gòu)比較顯示,NSP14的SAM結(jié)合位點具有顯著差異,為選擇性藥物設(shè)計提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
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在細(xì)胞水平實驗中,C10對多種SARS-CoV-2毒株(包括主要變異株)均展現(xiàn)出強效抑制作用,其半數(shù)抑制濃度(EC50)介于64.0至301.9 nM之間,與FDA批準(zhǔn)藥物瑞德西韋(remdesivir)相當(dāng)。更為重要的是,C10還表現(xiàn)出對其他β冠狀病毒的廣譜抗病毒活性,表明其作用機制具有普適性。
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抑制病毒復(fù)制并調(diào)控宿主應(yīng)答
機制研究表明,C10通過占據(jù)NSP14的SAM結(jié)合口袋,阻斷病毒RNA帽結(jié)構(gòu)甲基化,從而顯著抑制病毒翻譯及復(fù)制。同時,C10還能激活宿主免疫相關(guān)通路,表現(xiàn)出一定的免疫刺激效應(yīng)。更值得關(guān)注的是,研究團(tuán)隊通過轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn),C10可有效逆轉(zhuǎn)NSP14引起的宿主基因轉(zhuǎn)錄改變與細(xì)胞周期停滯,提示NSP14不僅參與病毒RNA加工,還通過調(diào)控宿主轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)促進(jìn)病毒感染與免疫逃逸。在轉(zhuǎn)基因小鼠感染模型中,C10顯著降低病毒載量并改善病理損傷,進(jìn)一步驗證了其在體內(nèi)的抗病毒效能。
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為新冠及其他病毒治療提供新方向
該研究首次系統(tǒng)揭示了非核苷類NSP14抑制劑的抗病毒機制與宿主調(diào)控效應(yīng),并以C10為代表展示了其作為候選藥物的開發(fā)潛力。研究結(jié)果不僅為SARS-CoV-2及其變異株的治療提供了新思路,也為其他RNA病毒帽結(jié)構(gòu)甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑的設(shè)計提供了重要參考。
該研究由浙江大學(xué)藥學(xué)院謝偉(紫溪弘藥創(chuàng)始人)百人計劃研究員、董曉武教授與復(fù)旦大學(xué)張榮研究員共同通訊,浙江大學(xué)藥學(xué)院羅夢鑫/莫俊博士研究生與復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院王子樵博士研究生為共同第一作者,來自復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院感染與生物安全研究院、浙江大學(xué)第二附屬醫(yī)院及上海公共衛(wèi)生臨床中心等多家機構(gòu)的科研人員共同完成。研究得到了國家自然科學(xué)基金原創(chuàng)探索計劃項目與面上項目、國家重點研發(fā)計劃及浙江省重大科技專項等項目的支持。這項成果展示了中國科研團(tuán)隊在冠狀病毒分子機制解析與抗病毒藥物開發(fā)領(lǐng)域的持續(xù)創(chuàng)新與國際影響力,為應(yīng)對未來可能出現(xiàn)的新型冠狀病毒及其他RNA病毒感染奠定了堅實的科學(xué)基礎(chǔ)。
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